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海南五指山猪TLR4基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄丽丽 1 ; 张艳 1 ; 刘海隆 1 ; 林哲敏 1 ; 谭树义 1 ;

作者机构： 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 五指山猪;TLR4基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2019 年 47 卷 008 期

页码： 41-46

收录情况： 北大核心

摘要： 为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征,以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列,采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析.结果显示,获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10435 bp,其中编码区全长2526 bp,共编码841个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比,存在38处突变(其中有2处突变位于编码区);与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9% 、80.7% 、79.9% 、74.8% 、74.7% 、73.1% 、73% 、72.7% 、62.5% 、43.4%;五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白,具有亲水性,有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点;氨基酸系统进化树分析表明,不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性.该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础.

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