文献类型: 中文期刊
作者: 晁哲 1 ; 任钰为 1 ; 孙瑞萍 1 ; 魏立民 1 ; 刘海隆 1 ; 邢漫萍 1 ; 黄丽丽 1 ; 郑心力 1 ;
作者机构: 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室
关键词: 海南黑山羊;皮下脂肪;基因;信使RNA;长链非编码RNA
期刊名称: 畜牧与兽医
ISSN: 0529-5130
年卷期: 2023 年 003 期
页码: 1-7
收录情况: 北大核心
摘要: 为了研究海南黑山羊与其F1代杂交羊(努比亚山羊公羊与海南黑山羊母羊杂交)皮下脂肪组织的遗传差异,本研究采用RNA-Seq技术和生物信息学方法对2种山羊皮下脂肪组织进行转录组测序分析,运用DESeq鉴定2种山羊皮下脂肪组织间差异表达的mRNAs和lncRNAs,对差异表达的mRNAs进行GO功能、KEGG通路富集分析,同时对差异表达的lncRNAs进行靶基因预测分析。结果显示:海南黑山羊与其F1代杂交羊皮下脂肪间存在330个差异表达的mRNAs,其中4个基因在F1代杂交羊皮下脂肪中特异表达、1个基因在海南黑山羊皮下脂肪中特异表达,在330个差异表达的mRNAs中,根据差异倍数大小,排名前10位的基因分别是PLXDC1、AOC1、SHROOM3、NTS、SPATS2、LOC102181165、BDKRB2、GSDMA、ETNK2、EPOR;存在138个差异表达的lncRNAs,其中9个在F1代杂交羊皮下脂肪中特异表达、5个在海南黑山羊皮下脂肪中特异表达。此外,本研究共获得143个差异表达lncRNAs顺式作用靶基因和135个差异表达lncRNAs反式作用靶基因。本研究为进一步研究山羊皮下脂肪沉积的遗传机理提供科学依据。
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