文献类型: 中文期刊
作者: 吴尉凤 1 ; 饶秋华 2 ; 柯文辉 3 ; 刘洋 2 ; 卓艺蓉 1 ; 郑欣欣 1 ; 罗土炎 2 ;
作者机构: 1.福建海洋职业技术学校
2.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室
3.福建省台湾农业研究中心
关键词: 金鱼;维氏气单胞菌;全基因组测序;基因注释
期刊名称: 福建农业科技
ISSN: 0253-2301
年卷期: 2021 年 52 卷 007 期
页码: 18-25
摘要: 维氏气单胞菌(Aeromonasveronii JY01)是从福州某养殖场内金鱼烂尾、腐皮和溃疡等病灶处分离出的1株革兰氏阴性优势菌.为了解其基因组结构及功能特征,基于IlluminaPE150和Pacbio测序平台对维氏气单肥菌菌株JY01进行全基因组测序,并对测序数据进行组装和组分分析,利用生物信息学手段进行基因预测与功能注释、同时预测致病因子和耐药基因.结果 表明:维氏气单肥菌菌株JY01基因组序列长度为4.97 Mb,GC含量为58.17%;共预测到4601个编码基因、31个rRNA、16个基因岛及124个tRNA;其中,3461个基因在COG中获得注释,3082个基因聚集到GO聚类分析中,4345个基因在KEGG代谢通路中富集,预测维氏气单胞菌菌株JY01携带13种毒力因子包含240个相关毒力基因及9大类抗生素耐药性包含175个抗生素耐药基因.
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