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猪乙脑病毒WHe株的PrM-E、NS1、E-NS2A基因的克隆及序列测定

文献类型: 中文期刊

作者: 乔宪凤 1 ; 熊东海 2 ; 郑新民 1 ; 徐涤平 1 ; 赵浩斌 1 ; 魏庆信 1 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院

2.华中农业大学

关键词: 日本乙型脑炎病毒;NS1、prM_E、E_NS1_NS2A基因;基因克隆;核酸序列

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2003 年 25 卷 03 期

页码:

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本文通过RT_PCR扩增了猪乙型脑炎病毒WHe株主要抗原基因NS1(约 1.14kb)、prM_E(约 2 .1kb)、E_NS1_NS2A (约 3.0kb) ,并将NS1、E_NS1_NS2A、PrM_E基因克隆、测序。与Genbank发表的JEV基因序列进行序列分析 ,发现WHe株与其他 12种典型的JEV强毒株的同源性在 88.3%~ 99.4 %之间。WHe株与K94P0 5株的同源性最低 (88.3% ) ,与P3株的同源性最高 (99.4 % ) ,可认为WHe株是由P3株衍生而来的。在JEV基因组 5’端 389~ 3910的长 35 2 2nt的决定JEV抗原性的C_prM_E_NS1_NS2A区中 ,WHe株与P3株仅有 2 1个碱基不同 ,其中的 14个单碱基突变为同义突变 ,另外7个为错义突变 ,导致相应的氨基酸序列 (1173个 )中的 6个氨基酸发生了变异 ,其中的 5个氨基酸变异出现在含有各关键的抗体中和决定簇的E蛋白内 ,另一个位于NS1蛋白内。

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