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藜麦Hsf家族的进化与多胁迫条件下的转录应答

文献类型: 中文期刊

作者: 陈诗佳 1 ; 张戎金蕾 1 ; 蒋礼玲 2 ; 陈志伟 3 ; 张真真 1 ; 贾举庆 3 ; 王明雪 1 ; 黄胜雄 1 ;

作者机构: 1.合肥工业大学食品与生物工程学院

2.三江源生态与高原农牧业国家重点实验室/青海大学农林科学院/农业农村部作物基因资源与种质创新青海科学观测试验站/国家作物种质复份库

3.山西农业大学农学院

关键词: 藜麦;Hsf;进化;胁迫;转录应答

期刊名称: 应用与环境生物学报

ISSN: 1006-687X

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 129-136

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: Hsf转录因子参与调控植物在生物和非生物胁迫下的防御应答机制.基于系统的生物信息学分析方法,对藜麦Hsf家族成员进行序列特征、进化和多种生物和非生物逆境胁迫下的基因表达水平分析.在藜麦基因组中共鉴定得到31个Hsf转录因子,主要分布在7号染色体.系统进化树将藜麦31个Hsf成员划分到A1-A9、B1-B5和C组中;但藜麦Hsf成员在A6、A8、B5亚组中出现了缺失.藜麦Hsf成员的HR-A/B区域蛋白序列比对结果进一步支持了进化树中藜麦Hsf成员的聚类结果.藜麦Hsf成员蛋白序列中保守区域的分布呈现出组别特异性.A组Hsf成员的蛋白序列包括HSF domain、HR-A/B、NLS、NES和CTAD在内的保守区域;B组和C组的Hsf成员则缺失了CTAD.在干旱、高温、盐、低磷胁迫和GCFSV病毒侵染下,31个藜麦Hsf基因的表达模式被阐明;其中大量Hsf基因的表达水平被显著地诱导表达,推测其参与了藜麦在生物和非生物胁迫下的防御应答反应.本研究结果可为藜麦抗逆品种的遗传育种提供大量优良候选Hsf基因.(图6表1参28)

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