您好,欢迎访问青海省农林科学院 机构知识库!

青稞早抽穗主效QTL cqHD2H-2的遗传定位及候选基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 余鑫莲 1 ; 李新 1 ; 姚晓华 1 ; 姚有华 1 ; 白羿雄 1 ; 安立昆 1 ; 吴昆仑 1 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院/青海省青稞遗传育种重点实验室/国家麦类改良中心青海青稞分中心

关键词: 青稞;cqHD2H-2;分子标记;遗传图谱;HvNF-YB3

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2022 年 010 期

页码: 2463-2474

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 抽穗期是决定青稞品种的种植区域范围和季节适应性的重要农艺性状,也是青稞成熟早晚的关键标志。在前期实验中,青稞早抽穗主效QTL cqHD2H-2被定位于青稞2H染色体上约84 Mb的区间内,为进一步验证该位点的有效稳定性,本研究对cqHD2H-2进行定位验证及候选基因分析。利用早抽穗青稞品种DZZ与晚抽穗青稞品种KL10构建F5群体,在cqHD2H-2区段内开发InDel标记,共筛选到3个与目标基因紧密连锁的分子标记,扫描F5群体中的25株极端早抽穗和25株极端晚抽穗单株,获得1个侧翼共显性标记,将cqHD2H-2进一步限定在标记PA22和Va07之间约40Mb的区间内。该区段通过与大麦及水稻同源共线性比对,筛选到水稻抽穗期基因DTH8在大麦中的同源基因HORVU2Hr1G087460 (HvNF-YB3)。比较HvNF-YB3基因全长,发现Hv2H.NF-YB3 (DZZ)与Hv2H.nf-yb3 (KL10)编码区由1个外显子组成,编码区为750bp,启动子区为2116bp,Hv2H.NF-YB3与Hv2H.nf-yb3启动子区存在3个SNPs。Hv2H.NF-YB3与Hv2H.nf-yb3的表达分析表明,Hv2H.NF-YB3与Hv2H.nf-yb3在转录水平上存在显著差异,Hv2H.NF-YB3与Hv2H.nf-yb3在茎、芒和颖壳组织中均有表达,但相较于Hv2H.NF-YB3,Hv2H.nf-yb3在各组织中的表达量均显著下降,且二者随着生育期的推进,表达量均依次降低。因此, Hv2H.NF-YB3可能在青稞抽穗时间调控中发挥作用。本研究为青稞早抽穗分子标记辅助选择育种体系的建立及目标基因的图位克隆奠定了基础。

  • 相关文献

[1]青海大黄油菜粒色性状分子标记的开发和图谱整合. 赵会彦,肖麓,赵志,杜德志. 2014

[2]青稞Wx基因多态性与直链淀粉含量的关系. 吴昆仑,赵媛,迟德钊. 2012

[3]分子标记在青稞中的应用现状及前景. 张玉清. 2011

[4]PEG预处理对青稞种子萌发和幼苗生理特性的影响. 姚晓华,吴昆仑. 2012

[5]青海省青稞育种成就及发展方向. 王显萍,吴昆仑. 2010

[6]不同生态区青稞品种变异的SSR鉴定. 吴昆仑,陈丽华,迟德钊. 2010

[7]小麦孢囊线虫病对青稞危害损失的研究. HOU Sheng-ying,侯生英,WANG Ai-ling. 2010

[8]不同抗旱性青稞品种HVA1基因对干旱胁迫的响应及其表达模式研究. 姚晓华,吴昆仑,迟德钊. 2012

[9]青海大黄油菜Brsc1基因的精细定位及图谱整合. 李新,肖麓,杜德志. 2015

[10]青海大黄油菜黄籽基因SSR标记开发和图谱构建. 赵会彦,肖麓,杜德志. 2014

[11]四倍体马铃薯SSR遗传图谱的构建及晚疫病抗性QTL初步定位. 刘龙超,周云,贺苗苗,张艳萍,叶广继. 2016

[12]枸杞转录组SSR分布特征分析及其与基因组SSR分布特征的比较. 虞杭,张得芳,樊光辉,王占林. 2018

[13]蚕豆亚有限生长习性遗传规律分析及其基因初步定位. 周仙莉,滕长才,张红岩,韩雪梅,林夕,刘玉玲,吴小燕,侯万伟,刘玉皎. 2021

[14]青海高原青稞危害因子及防治方法. 任又成,段瑞君. 2011

[15]青稞幼苗干旱诱导蛋白的初步分析. 李洁. 2015

[16]青稞脂质转运蛋白基因blt4.9的克隆及其对非生物胁迫的响应. 姚晓华,吴昆仑. 2016

[17]多元化用途背景下青稞品种选育的思考与实践. 吴昆仑,姚晓华,姚有华,白羿雄,迟德钊. 2018

[18]青稞LTP蛋白基因bltl4.2的克隆及其在低温下的表达. 邓晓青,姚晓华,吴昆仑,迟德钊. 2012

[19]青稞种质资源的SSR标记遗传多样性分析. 吴昆仑. 2011

[20]青稞品种肚里黄成熟胚愈伤组织诱导与植株再生. 危文波,蒋礼玲,吴昆仑,迟德钊. 2015

作者其他论文 更多>>