您好，欢迎访问内蒙古农牧业科学院 机构知识库！
内蒙古农牧业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

彩色马铃薯查尔酮合酶基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 聂利珍 1 ; 李晓东 1 ; 谢锐 1 ; 房永雨 1 ;

作者机构： 1.内蒙古自治区农牧业科学院

关键词： 彩色马铃薯;查尔酮合成酶基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 023 期

页码： 7679-7686

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究彩色马铃薯块茎中花色苷积累的分子机制，明确查尔酮合成酶（CHS）在花色苷合成途径中作用，本研究以彩色马铃薯品种‘红美’块茎作为实验材料，根据GenBank数据库中已注册马铃薯CHS基因的cDNA序列设计引物，通过RT-PCR方法克隆了一个CHS基因，命名为StCHS1b。StCHS1b基因cDNA序列共1 223 bp，开放阅读框为1 170 bp，编码389个氨基酸。分子质量约为42.48 kD，理论等电点为6.3。生物信息学分析表明，该蛋白为亲水性的稳定蛋白质，而且含有CHS家族序列标签的保守区域GVLFGFGPGLT，无信号肽，不含有跨膜区。Blastn分析表明，StCHS1b基因序列与其他物种的CHS基因序列均具有较高同源性，编码区氨基酸相似性高达99%。进化分析表明，彩色马铃薯StCHS1b与番茄SlCHS、茄子Sm CHS、辣椒CaCHS、烟草NtCHS和黑果枸杞LrCHS聚在同一个分支，都属于茄科，它们的亲缘关系最近，与苹果MdCHS和覆盆子RiCHS亲缘关系较远。

  • 相关文献

[1]基于SRAP分子标记分析彩色马铃薯品种间遗传关系. 谢锐,金晓蕾,周继鸿,郭斌煜,郭景山,韩志刚. 2022

[2]山羊Claudin-1基因编码蛋白的生物信息学分析. 王梦雅,赵学亮,胡红莲,宋利文,李洋,徐明,高民. 2018

[3]沙拐枣甜菜碱醛脱氢酶基因的克隆与生物信息学分析. 房永雨,郝丽芬,聂利珍,丁海君,王力伟,赵小庆,孙杰,史志丹,何江峰. 2020

[4]马丙酮酸脱氢酶激酶4基因序列生物信息学分析. 陈建兴,马芷妍,刘永斌,刘娟,董彦飞,孙玉江. 2019

[5]少孢节丛孢菌Aoz1基因调控区的发掘及分析. 王新芳,尹相吉,聂福贵,陈湘江,郭宏年,梁萌,罗小平,钱英红,郭少平,杨晓野,王瑞. 2018

[6]蒙古冰草GDSL酯酶/脂肪酶基因的序列及表达分析. 闫秀秀,范菠菠,张学峰,于卓,房永雨,吴婧,赵彦,马艳红. 2023

[7]向日葵E3泛素连接酶基因克隆及表达分析. 张艳芳,孙瑞芬,郭树春,于海峰,石慧芹. 2016

[8]拟南芥AtCDPK1基因克隆与转化马铃薯的研究. 聂利珍,于肖夏,李国婧,鞠天华,孙瑞芬,崔阔澍,于卓. 2015

[9]甜菜细胞质雄性不育相关基因的克隆表达及CMS的相关性研究. 乌日汉,斯钦巴特尔,伊六喜,田自华. 2015

[10]向日葵V-ATPasea3亚基基因的克隆及表达分析. 张艳芳,孙瑞芬,郭树春,侯建华. 2017

[11]蒙古羊BMPR-IB基因的克隆与结构功能域预测. 何小龙,刘永斌,王美秀,李虎山,王峰,达赖,田春英,荣威恒. 2010

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：内蒙古农牧业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台