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基于小RNA技术的天津地区番茄花叶病毒分子检测与基因组部分序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 金凤媚 1 ; 薛俊 1 ; 孙海波 1 ; 郝志愚 1 ;

作者机构： 1.天津市农业科学院

关键词： 番茄;番茄花叶病毒;小RNA深度测序;分子检测;基因序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 005 期

页码： 176-183

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确引起天津地区番茄果实褐化的病因,采用小RNA深度测序技术和RT-PCR技术对采自天津的番茄病样进行鉴定分析。结果表明,引起天津地区番茄果实变褐的病原为番茄花叶病毒。进一步对该病毒进行了全基因组测序,并对该病毒的外壳蛋白（CP）、运动蛋白（MP）和126蛋白进行了序列分析。进化树分析结果表明,天津分离物的3个蛋白基因均与美国分离物USA99-1)的进化关系最近。相似性分析结果表明,CP基因与其他分离物的平均相似性为95.53%。MP基因与其他基因分离物的平均相似性为95.21%。126蛋白基因与其他分离物的平均相似性为92.72%。对这3个基因编码的蛋白进行分析,结果表明,不同分离物之间的平均相似性均在99.0%及以上。初步表明,在天津发生的番茄花叶病毒可能是由于贸易活动由国外传入天津市。

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