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基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析

文献类型: 中文期刊

作者: 者玉琦 1 ; 武志娟 1 ; 王吉坤 1 ; 钟金城 1 ; 柴志欣 1 ; 信金伟 1 ;

作者机构: 1.青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室;四川省青藏高原草食家畜工程技术中心;省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

关键词: 西藏牦牛;COX3基因;遗传多样性;系统进化

期刊名称: 草业学报

ISSN: 1004-5759

年卷期: 2023 年 09 期

页码: 231-240

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区(CDS)序列,利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性,并构建了系统发育树。结果表明,西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp,共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)及核苷酸多样性(Pi)分别为0.665和0.00480,说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类,类乌齐牦牛单独聚为一类,其余牦牛群体为一类。此外,11种单倍型可分为2个聚类簇,说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中,其中Hap_2、Hap_3、Hap_4、Hap_6、Hap_7、Hap_8、Hap_10、Hap_11这8个单倍型属于家牦牛支系,Hap_5和Hap_9属于原牛和普通牛支系,Hap_1属于野牦牛支系,说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源,但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。

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