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我国原生动物研究文献计量学分析

安徽农业科学 2023

摘要:原生动物是简单的真核单细胞动物,随着研究方法不断完善,原生动物开始受到国家和研究者的关注.为了深入了解原生动物的发展现状,检索了中国知网(CNKI)数据库1983年至今关于我国原生动物的相关文献,利用Excel、Origin等统计软件对检索到的3 872篇原生动物研究文献的年发表数量、学科领域分布、核心作者、机构分布、文献来源以及基金项目分布等进行了分析,探讨了原生动物研究的发展现状及方向.结果显示,1983年来我国原生动物研究呈上升趋势,之后略微下降,最后呈稳定趋势.原生动物的研究主要集中在应用基础研究、基础研究、技术研究等层次以及涉及生命科学、农业、水产、林业等 30 个学科,文献发布机构主要集中在研究所、高校等.文献来源分布比较多,发文量最多的为《生物学通报》,共91篇,其次为《水生生物学报》66篇;基金项目方面,国家自然科学基金资助的文章数量最多.此外,利用现代分子手段阐述原生动物的微观调控机制将是未来发展方向之一,该研究结果可为原生动物的进一步研究提供参考方向.

关键词: 原生动物 群落特征 多样性 文献计量

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茶六斑褐锦斑蛾Sorita pulchella线粒体基因组特征与系统发育分析

河南农业大学学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:【目的】了解茶六斑褐锦斑蛾(Sorita pulchella)线粒体基因组特征,探究其分类地位,并分析蛾类高级分类阶元的系统发育关系。【方法】野外采集西藏自治区林芝市易贡茶场发生的茶六斑褐锦斑蛾。采用高通量测序的方法获得线粒体基因组序列并分析其基因组结构特征;用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树,探讨鳞翅目斑蛾科昆虫系统发育关系。【结果】茶六斑褐锦斑蛾(GenBank登录号:MZ157403)线粒体基因组序列的总长度为15 216 bp,编码37个基因,即13个蛋白质编码的基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因(rrnL和rrnS)和1个A+T富含区。其基因组成与其它已知的鳞翅目昆虫一致。蛋白质编码基因的A+T的含量为77.7%,长度为10 830 bp。tRNA中的A+T的含量则为80.9%。22个tRNA的二级结构仅trnS1缺少二氢尿嘧啶环,其它tRNA的二级结构都为典型的三叶草型。20个种进行了系统发育分析,包括两个外群。贝叶斯系统发育树显示斑蛾科内的系统发生关系为:(Zeuzera multistrigata+Endoxyla cinereus)+(((Apoda limacodes+Narosa nigrisigna)+((Iragoides fasciata+(Thosea sinensis+Thosea sythoffi))+(Parasa consocia+(Mahanta tanyae+Monema flavescens))))+((Phauda flammans+Zygaenafilipendulae+((Illiberis pruni+Illiberis ulmivora)+(Pidorus atratus+((Amesia sanguiflua+Rhodopsona rubiginosa)+Eterusia aedea+(Histia rhodope+Sorita pulchella)))))))。最大似然树的结果为:(Endoxyla cinereus+Zeuzera multistrigata+((Apoda limacodes+Narosa nigrisigna)+((Iragoides fasciata+(Thosea sinensis+Thosea sythoffi))+(Parasa consocia+(Mahanta tanyae+Monema flavescens)))+(Zygaena filipendulae+(Phauda flammans+((Illiberis pruni+Illiberis ulmivora)+(Pidorus atratus+((Amesia sanguiflua+Rhodopsona rubiginosa)+(Histia rhodope+(Eterusia aedea+Sorita pulchella)))))))))。【结论】斑蛾科和刺蛾科皆为单系群。贝叶斯系统发育结果表示,六星斑蛾和朱红毛斑蛾分化较早,梨星毛虫与榆斑蛾互为姐妹群,玉带斑蛾单独成为一支,釉锦斑蛾和黑心赤眉锦斑蛾互为姐妹群,茶六斑褐锦斑蛾与重阳木褐锦斑蛾互为姐妹群,它们组成的一支再与茶柄脉锦斑蛾互为姐妹群。

关键词: 茶六斑褐锦斑蛾 线粒体基因组 高通量测序 系统发育关系

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牦牛骨骼肌中特异基质金属蛋白酶及其功能相关基因的表达分析

中国畜牧兽医 2023 北大核心 CSCD

摘要:【目的】筛选并鉴定在牦牛骨骼肌中特异表达的基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases, MMPs)家族成员及其功能相关基因,以期为研究牦牛骨骼肌结构形成机制提供依据。【方法】采集成年公牦牛臀肌和胸肌,利用组织化学染色法(HE和Masson)分析肌纤维特征和胶原纤维数量;通过实时荧光定量PCR鉴定MMPs和基质金属蛋白酶抑制因子(TIMPs)的mRNA表达量;采用Western blotting技术和免疫组织化学法分析MMPs、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白的表达量和组织分布;通过STRING网站分析MMPs及其功能相关基因之间的蛋白质互作网络;采用EnzChekTM明胶酶/胶原酶试剂盒检测牦牛臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性差异。【结果】Masson染色和实时荧光定量PCR分析结果显示,牦牛臀肌中胶原纤维面积、MMP-2和MMP-14基因表达量显著低于胸肌(P<0.05),TIMP-3基因在牦牛臀肌中表达量显著高于胸肌(P<0.05)。Western blotting鉴定发现,MMP-3、MMP-14、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量极显著或显著低于胸肌(P<0.01;P<0.05)。免疫组织化学法分析显示,MMP-2、MMP-9、MMP-14和Ⅰ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量显著或极显著低于胸肌(P<0.05;P<0.01),而MMP-16在牦牛臀肌中的表达量显著高于胸肌(P<0.05)。蛋白质功能相关性聚类分析表明,MMP-2、MMP-14、MMP-16、TIMP-2、TIMP-3、COL1A2和COL3A1可聚为一簇,MMP-3、MMP-9和TIMP-1可聚为一簇;臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性变化趋势一致,且差异不显著(P>0.05)。【结论】MMPs家族成员及其功能相关基因在牦牛骨骼肌中广泛表达,且在臀肌和胸肌中的表达量存在差异,为进一步研究MMPs调控牦牛骨骼肌结构形成的作用机制提供了参考依据。

关键词: 牦牛 骨骼肌 基质金属蛋白酶(MMPs) 胶原蛋白

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牦牛血抗氧化肽发酵制备工艺优化及结构分析研究

食品安全质量检测学报 2023 北大核心

摘要:目的 优化牦牛血抗氧化肽的发酵制备工艺并分析其结构。方法 在单因素实验的基础上,开展牦牛血抗氧化肽制备的响应面优化实验。采用液相色谱-串联质谱法(liquidchromatography-tandemmass spectrometry,LC-MS/MS)对经冷冻干燥处理后的牦牛血抗氧化肽的肽段组成及其序列进行检测。结果 牦牛血抗氧化肽制备的最佳工艺条件为:底物质量浓度65g/L、接种量2.0%、发酵时间71h。在此条件下,牦牛血抗氧化肽的羟基自由基清除率为88.21%。根据其氨基酸组成、肽段序列、分子量大小筛选出可能具有较好抗氧化活性的肽段20条,其所匹配的蛋白为A0A6B0QV06、A0A6B0QW84。经蛋白质数据库Uniprot鉴定分析,此两类蛋白质已形成由两条α链和两条β链组成的异四聚体结构,可促进动物肺脏器官中的氧气运输到其他脏器组织中,具有抗缺氧的作用。结论 采用枯草芽孢杆菌液态发酵法制备牦牛血抗氧化肽,可增大牦牛血的利用率,减少资源的浪费。

关键词: 牦牛血 发酵 抗氧化肽 蛋白质 结构

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西藏年楚河流域沙棘林大型土壤动物群落特征及其影响因素

四川农业大学学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:【目的】为了解西藏年楚河流域沙棘林大型土壤动物群落特征及其与环境因子的关系。【方法】于2020年5月、8月和10月,根据沙棘林的地理分布特征共设置5个样地25个采样点,采用手捡法对75个土壤样品的表面和样品内大型土壤动物进行了调查,同时测得相应的环境因子。【结果】经3次采样,共捕获大型土壤动物798头,隶属于3门5纲17目28科39类群。其中优势类群为蚁科(Formicidae)、狼蛛科(Lycosidae)和石蜈蚣科(Lithobiidae),占总捕获量的62.90%;常见类群10类,占28.32%;稀有类群共26类,占8.77%。单因素方差分析显示,大型土壤动物个体数、类群数、Shannon-wiener多样性指数(H)、Simpson优势度指数(C)和Pielou均匀度指数(E) 3个季节间均无显著差异(P>0.05)。Jaccard相似性结果显示,5个样地的土壤动物分布具有一定差异,主坐标分析(PCOA)结果显示,土壤动物在季节间相似程度具有差异性。Pearson相关性分析结果显示,海拔、土壤含水量、土壤温度、pH、总氮和有效磷与土壤动物的群落特征具有显著相关性(P>0.05)。冗余分析(RDA)结果显示,排序轴1和2最能反映大型土壤动物群落类群组成变化的影响因子梯度,有效磷(AP)是显著解释变量。【结论】大型土壤动物各项生物指标3个季节间无显著差异(P>0.05),其群落特征时空分布具有一定差异性,海拔、土壤含水量、土壤温度、pH、总氮和有效磷是影响沙棘林大型土壤动物的重要因子。

关键词: 年楚河流域 沙棘林 土壤动物 群落特征 环境因子

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犏牛BMP4基因的克隆、生物信息学分析及在附睾的表达研究

中国畜牧杂志 2023 北大核心 CSCD

摘要:骨形态发生蛋白4(BMP4)基因在哺乳动物生殖机能方面起着重要的调控作用.本研究通过分子克隆技术对犏牛BMP4基因的编码区序列进行克隆,分析BMP4基因的生物信息学特征及其在附睾组织中的表达特点.生物信息学分析结果显示:犏牛BMP4基因CDS区片段长1371 bp,编码456个氨基酸;BMP4蛋白存在一层跨膜结构,肽链中亲水性氨基酸的数量显著高于疏水性氨基酸,表明具有亲水性;组成犏牛BMP4蛋白的456个氨基酸中,100个氨基酸位于α螺旋区,占氨基酸总数的21.93%,82个氨基酸位于延伸链区,占总数的17.98%,14个氨基酸位于β转角区,占总数的3.07%,260个氨基酸以无规则状态存在,占总数的57.02%;犏牛BMP4氨基酸序列与牦牛、绵羊等物种存在较高的同源性,分别为99.2%和99.3%.qPCR分析结果显示:犏牛BMP4基因在附睾体部的表达显著高于头部和尾部.本研究为进一步探讨犏牛精子成熟机制及BMP4基因在犏牛附睾不同部位的作用机制提供了基础数据.

关键词: 犏牛 附睾 BMP4基因 生物信息学分析

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青稞品种对青稞发酵酒营养与感官品质的影响

食品科学 2023 EI 北大核心 CSCD

摘要:本研究以7种西藏特有的青稞品种及相应发酵青稞酒为对象,基于理化性质、营养、风味和感官等指标,采用典范对应分析(canonical correspondence analysis,CCA)和主成分分析(principal component analysis,PCA)等探究青稞品种与其发酵酒品质的关系。研究表明,与青稞原粮相比,青稞酒体氨基酸中必需氨基酸占比增加,可能是酿造过程中非必需氨基酸转化形成了必需氨基酸。CCA结果显示不同品种青稞原粮在总氨基酸、γ-氨基丁酸、β-葡聚糖和总多酚含量等方面具有一定相似性,但其营养结构的差异经微生物生物化学转化得以放大,为筛选青稞酒的优质品种提供了可能。通过青稞原粮及相应青稞酒中的蛋白质、氨基酸、γ-氨基丁酸和总多酚水平等营养指标分析初步优选出‘藏青2000’为酿酒青稞品种,其次是‘隆子黑’‘芶芝黑’‘藏青25’。结合青稞酒营养、风味和感官等多维度指标,最终确定‘藏青2000’为最佳酿酒青稞品种,其次为各具特色风味的‘芶芝黑’‘隆子黑’‘藏青25’。本研究可为我国青稞酒领域的发展提供参考。

关键词: 营养特征 风味结构特征 关联性分析 感官评价 典范对应分析 主成分分析

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一株血红栓孔菌的多糖抗氧化及抗Huh7肝癌细胞的活性

菌物学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:对一株野生栓孔菌属的真菌子实体进行分离鉴定,探究其生长特性,并比较菌丝体胞内多糖和发酵液胞外多糖的抗氧化作用、抑癌活性及多糖组分。研究结果显示,该菌株经鉴定为血红栓孔菌Trametes sanguinea,菌丝生长最适条件碳源为甘露糖,氮源为酵母浸提物,pH值为6.0,温度为35℃;胞外多糖比胞内多糖更具有化学抗氧化能力,当多糖浓度为5mg/mL时,胞内多糖对DPPH、ABTS和羟自由基的清除率分别为57.54%、97.20%和36.40%,铁离子还原力的FRAP值为1.14mmol/L,而胞外多糖对DPPH、 ABTS和羟自由基的清除率分别为63.88%、 99.36%和40.99%,FRAP值为2.34mmol/L;胞外多糖的抑癌活性强于胞内多糖,在供试浓度下多糖溶液对LO2细胞无毒副作用,但能明显抑制Huh7细胞增殖,胞内和胞外多糖的IC50值分别是4.154和2.894mg/mL;进一步对比分析其单糖的组分和含量,发现除了葡萄糖、盐酸氨基葡萄糖、甘露糖和半乳糖外,胞外多糖比胞内多糖还多了岩藻糖、葡萄糖醛酸和木糖,胞内多糖中仅有葡萄糖含量高于胞外多糖,这表明胞内多糖与胞外多糖活性可能与其单糖组成和含量有关。这为血红栓孔菌资源的进一步开发利用提供参考资料。

关键词: 血红栓孔菌 培养特性 抗氧化 抗癌

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青稞储藏过程中品质变化及其动力学研究

粮食与油脂 2023 北大核心

摘要:以林芝地区青稞粒、青稞粉为原料,在常温(平均温度20℃RH70%)、30℃RH70%、40℃RH70%条件下进行储藏试验;分析储藏过程中脂氧合酶(LOX)、脂肪酶(LPS)、过氧化氢酶(CAT)活力和色泽变化规律。结果表明:随着储藏时间的延长,青稞粒、青稞粉LPS酶活力整体呈下降趋势;储藏温度对青稞粒、青稞粉的L、a、b、ΔE无显著影响,但其与LOX、CAT酶活力呈极显著负相关;储藏时间极显著影响LPS酶活力;采用一级动力学模型则可较好地反映LOX、LPS、CAT酶活力和L、a、b、ΔE的变化规律。

关键词: 青稞 酶活力 色泽 相关性 动力学

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L-肉碱在反刍动物体内的合成代谢及其在生产中的应用研究进展

中国畜牧杂志 2023 北大核心 CSCD

摘要:L-肉碱是一种广泛存在于动物界的类维生素季铵盐化合物,以赖氨酸为底物在动物体的肝脏和肌肉中内源性合成.长期以来,L-肉碱不仅被认为在能量代谢方面发挥着重要作用,还被证明具有抑制氧化损伤和增强机体免疫力等功能.因此,国内外开展了大量关于补充L-肉碱在改善家畜性能方面的研究,但大多数研究集中在猪、鸡等单胃动物,对反刍动物研究较少.与单胃动物不同,反刍动物特殊的瘤胃生理环境以及瘤胃微生物对L-肉碱的降解在一定程度上影响了L-肉碱在反刍动物中的应用效果.本文简述了L-肉碱的生理特性及其在反刍动物体内的合成与代谢,并补充了L-肉碱对反刍动物生产性能的影响,以期为L-肉碱在反刍动物中的应用提供理论依据.

关键词: L-肉碱 生理功能 反刍动物

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