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利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因

文献类型： 中文期刊

作者： 郑洪亮 1 ; 孙世臣 1 ; 丁国华 1 ; 王彤彤 1 ; 赵宏伟 2 ; 王敬国 2 ; 刘化龙 2 ; 韩笑 2 ; 邹德堂 2 ; 来永才 3 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院博士后科研工作站

2.东北农业大学寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室

3.黑龙江省农业科学院

关键词： 粳稻;直链淀粉含量;GWAS;候选基因

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 21-31

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 直链淀粉含量是评价稻米蒸煮食味品质关键指标,挖掘控制该性状QTLs/基因对于改良稻米品质具有重要意义。研究利用295份粳稻种质组成的自然群体为试验材料,测定2019年和2020年稻米直链淀粉含量,结合重测序得到788 396个高质量SNP,利用Tassel 5.0软件混合线性模型（MLM,Q+K）作全基因组关联分析。结果表明,两年共检测到12个与稻米直链淀粉含量相关QTL,分布在水稻第3、4、11和12染色体上,贡献率范围为8.78%～11.62%,其中qAAC4-2和qAAC12-2在两年中重复检测到。进一步针对这两个QTL区间内所有基因作单倍型分析,结合基因注释和前人研究结果,推测LOCOs04g33640为影响稻米直链淀粉含量新候选基因。

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