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细粒棘球绦虫TSP8基因在其不同发育阶段的差异表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王炜烨 1 ; 王云菲 1 ; 陆宝燕 1 ; 马勋 1 ; 张艳艳 2 ; 孟季蒙 2 ; 王正荣 2 ; 薄新文 1 ;

作者机构: 1.石河子大学动物科技学院

2.新疆农垦科学院畜牧兽医研究所 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

关键词: 细粒棘球绦虫;基因克隆;差异表达;生物信息学分析

期刊名称: 中国动物传染病学报

ISSN: 1674-6422

年卷期: 2022 年 30 卷 001 期

页码: 157-165

收录情况: 北大核心

摘要: 为研究细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus,E.g)TSP8基因的分子特性以及其在虫体不同发育阶段的差异表达,根据NCBI GenBank数据库中的TSP8基因设计1对特异性引物,对TSP8基因进行PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,通过生物信息学软件分析预测TSP8基因的结构与功能,并通过SYBR GreenⅠqRT-PCR方法分析TSP8基因在虫体原头蚴、包囊壁以及成虫mRNA相对转录情况.结果显示:成功克隆到细粒棘球绦虫TSP8基因序列,与细粒棘球绦虫跨膜蛋白(GenBank登录号:CDS17460.1)同源性为100%;进一步生物信息学分析显示,TSP8基因全长669个核苷酸,编码222个氨基酸,理论等电点为5.06,为稳定蛋白分子;TSP8基因编码的氨基酸序列共含有5个跨膜区域,含有4个优势B抗原表位;qRT-PCR结果显示TSP8基因在原头蚴及成虫阶段均有表达,差异显著,具有统计学意义(P<0.05).本研究对细粒棘球绦虫TSP8基因的分子特性进行了初步研究,为进一步揭示其生物学功能奠定了基础.

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