文献类型: 中文期刊
作者: 黄冬维 1 ; 汪勇 2 ; 杨普 1 ; 程广龙 1 ; 汪善义 2 ; 吴东 1 ; 赵小伟 1 ; 杨永新 1 ; 王小飞 1 ; 赵辉玲 1 ;
作者机构: 1.安徽省农业科学院
2.安徽省义华农牧科技有限公司
关键词: 皖南黄兔;IGF1基因;扩增;多态性
期刊名称: 中国草食动物科学
ISSN: 2095-3887
年卷期: 2016 年 36 卷 06 期
页码: 6-10
摘要: 胰岛素样生长因子1(IGF1)是动物生长发育等生命过程中的重要调节因子,目前关于家兔IGF1基因序列扩增和多态性的研究还很少。该研究以安徽皖南黄兔为试验动物,通过PCR方法扩增其IGF1基因编码区全序列,利用混合DNA池测序和生物信息学方法分析了IGF1基因扩增区域的遗传变异特性。结果获得皖南黄兔IGF1基因包含第1~5外显子的基因组序列5条,长度分别为316、657、691、757和403 bp,与种子序列一致性分别为100%、99.5%、99.9%、99.7%和99.8%;5个外显子组成432 bp的CDS序列,编码143个氨基酸残基组成的蛋白质。测序和生物信息学分析结果则表明,在皖南黄兔IGF1基因内含子1中存在3个多态位点(3056G>A、3107T>C和3164 G>A),3个位点并不位于剪接位点,但分别位于MZF1、ATF4、CEBPA、HLF和NKX2-8顺式作用元件位置,因而可能影响基因表达。该研究成功扩增获得皖南黄兔IGF1基因全部5个外显子序列,拼接获得基因编码区全序列,并利用混合DNA池测序法发现了内含子3个新的SNP位点,研究结果为揭示肉兔IGF1基因功能奠定了基础。
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