您好，欢迎访问青海省农林科学院 机构知识库！
青海省农林科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

干旱胁迫下大蒜叶绿素合成基因家族鉴定分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王紫彤 1 ; 周倩怡 1 ; 田洁 1 ;

作者机构： 1.青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室

关键词： 大蒜;干旱胁迫;叶绿素合成基因;生物信息学分析

期刊名称： 植物资源与环境学报

ISSN： 1674-7895

年卷期： 2022 年 003 期

页码： 54-64,74

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究干旱胁迫对大蒜（Allium sativum Linn.）叶绿素合成的影响，本研究基于大蒜转录组测序数据，筛选出响应干旱胁迫的大蒜叶绿素合成基因家族成员，利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术验证其表达情况后，采用生物信息学方法鉴定其序列属性。结果表明：从大蒜转录组数据中搜索得到的17个叶绿素合成基因家族中，筛选出6个积极响应干旱胁迫的大蒜叶绿素合成基因家族，即AsHEMA、AsHEMB、AsGSA、AsCHLD、AsCHLI和AsCAO。qRT-PCR和RNA-Seq结果显示：干旱胁迫6 d,AsHEMA、AsHEMB、AsGSA、AsCHLD、AsCHLI和AsCAO基因家族成员的表达量总体上显著增加。生物信息学分析结果显示：大蒜上述6个基因家族32个unigenes编码序列的氨基酸残基数为104～773,理论相对分子质量为11 978～84 411,理论等电点为pI 4.78至pI 9.86,不稳定指数为24.66～60.13,脂溶系数为80.04～104.59;除AsGSA家族外，其余5个家族成员的总平均亲水性为负值，即AsGSA家族成员为亲水蛋白，其余5个家族成员为疏水蛋白。保守基序分析结果表明：大蒜这6个叶绿素合成基因家族成员编码的氨基酸序列具有较高的保守性和相似性，其中，AsHEMA、AsGSA和AsCHLD家族高度保守；AsHEMB、AsCHLI和AsCAO家族保守性也较高，仅个别家族成员存在差异。进化树结果显示：大蒜同一叶绿素合成基因家族成员聚在一起，说明各基因家族的成员在进化上具有较高的保守性和相似性；AsHEMA、AsHEMB、AsCHLD、AsCHLI和AsCAO基因家族与单子叶植物小麦（Triticum aestivum Linn.）、石刁柏（Asparagus officinalis Linn.）和玉簪[Hosta plantaginea（Lam.） Aschers.]相关基因的同源性较高。上述研究结果显示：AsHEMA、AsHEMB、AsGSA、AsCHLD、AsCHLI和AsCAO基因家族的保守性和相似性较高，在大蒜响应干旱胁迫中发挥重要作用。

  • 相关文献

[1]大蒜糖转运蛋白基因AsSWEET14克隆与胁迫表达分析. 郑晓雯,徐庭亮,田洁. 2023

[2]干旱胁迫下大蒜果聚糖代谢关键酶基因的表达分析. 边海燕,钟启文,黄思杰,王丽慧,杨世鹏,田洁. 2018

[3]干旱胁迫对大蒜生长及生理特性的影响. 田萌,王丽慧,钟启文,边海燕,田洁. 2018

[4]大蒜干物质积累与硒的吸收、分配及累积特性研究. 张荣. 2012

[5]乐都紫皮大蒜春、秋播对植物学性状及产量的影响. 李江. 2015

[6]大蒜鳞茎诱导技术研究. 薛寒青. 2008

[7]大蒜根尖培养诱导不定芽研究. 薛寒青,王舰,周淑兰,高霞. 2011

[8]大蒜干物质积累与硒的吸收和分配及累积特性研究. 张荣,张洋,吴丽军,孙小凤. 2012

[9]大蒜可溶性糖积累与分配特性研究. 王丽慧,方云花,刘青元,李莉. 2014

[10]栽培措施对乐都紫皮蒜干物质积累与转运的影响. 方云花,王丽慧,马元鑫,谭龙,李莉. 2012

[11]大蒜生长过程中鳞茎可溶性糖组分及含量变化特征. 方云花,刘青元,王丽慧,马元鑫,谭龙,李莉. 2013

[12]栽培措施对大蒜品质及其产量的影响. 刘素英. 2012

[13]高原大蒜干物质积累与分配特性. 方云花,王丽慧,马元鑫,谭龙,李莉. 2012

[14]大蒜农艺性状与鳞茎果聚糖含量相关性分析. 田萌,王丽慧,杨世鹏,钟启文,田洁. 2018

[15]大蒜果聚糖的水解方法及其定量分析. 田洁,王启璋,钟启文. 2022

[16]大蒜转录组简单重复序列标记分析与分子标记开发. 刘新雨,田洁. 2020

[17]有机肥替代化肥对大蒜产量、品质及土壤养分的影响. 王明文,张洋,胥婷婷,许显虹,张荣. 2021

[18]大蒜果聚糖合成相关基因As6G-FFT的克隆及表达分析. 田洁,边海燕,铁原毓. 2021

[19]大蒜己糖激酶基因AsHXK2的克隆及其参与根际促生菌缓解干旱胁迫的表达分析. 郭春倩,田洁. 2022

[20]大蒜内参基因筛选及AsACO基因对盐胁迫和促生菌的响应分析. 王启璋,张祥林,韩睿,田洁. 2022

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：青海省农林科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台