您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

50份黄瓜核心种质的SSR标记筛选与聚类分析

文献类型: 中文期刊

作者: 金庆敏 1 ; 林毓娥 1 ; 吴廷全 2 ; 钟玉娟 1 ; 王瑞 2 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室

2.广东省农业科学院设施农业研究所

关键词: 黄瓜;核心种质;SSR标记;多态性分析;聚类分析;遗传多样性

期刊名称: 广东农业科学

ISSN:

年卷期: 2023 年 009 期

页码: 39-48

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分析50份来自全国各地的黄瓜核心种质资源的遗传多样性,为黄瓜育种提供依据和参考。【方法】对50份黄瓜核心种质资源的重要外观农艺性状进行统计,并利用全基因组设计66对SSR引物对其进行分子标记筛选及遗传多样性聚类分析。【结果】供试50份黄瓜核心种质材料的瓜皮颜色、刺瘤、瓜皮斑纹具有多样性。66对引物中有32对引物能够在不同黄瓜种质间扩增出清晰而稳定的多态性标记,这32对SSR引物共扩增出280个等位基因片段,其中多态性片段216个、占片段总数的77.1%,表明本研究筛选出的32对SSR引物遗传多态性较高,适用于黄瓜种质材料的遗传多样性分析。聚类结果与所调查的种质资源性状表现结果较为一致。50份黄瓜核心种质遗传相似系数最低为0.62、最高达1.00。在遗传相似系数0.754处,50份黄瓜种质材料聚为7类,即9份华南型材料聚为6类:Ⅰ类、Ⅲ类、Ⅳ类、Ⅴ类、Ⅵ类、Ⅶ类,其中Ⅳ类包含1份中间材料与9号华南型材料;40份华北型黄瓜材料聚为1类:Ⅱ类。表明华北型黄瓜材料和华南型黄瓜材料间相似系数低、亲缘关系远;华北型黄瓜材料间相似系数高、亲缘关系近、遗传背景窄、遗传多样性差;而华南型黄瓜材料间相似系数较低、亲缘关系较远、遗传背景宽、遗传多样性丰富。【结论】筛选出32对SSR引物可有效对50份黄瓜核心种质材料进行聚类分析,遗传相似系数为0.754处50份黄瓜材料聚为7类,其结果与性状调查结果相吻合;华北型黄瓜遗传背景窄、遗传多样性差,华南型黄瓜遗传背景相对较宽,遗传多样性丰富。

  • 相关文献

[1]华南地方稻种资源初级核心种质构建. 陈雨,潘大建,刘斌,范芝兰,曲延英,陈建酉,李晨. 2008

[2]SRAP和SSR标记在枇杷种质资源遗传多样性研究中的应用. 乔燕春,洪燕萍,林顺权,刘成明,郭栋梁. 2010

[3]用SSR标记分析1949—2005年华南地区常规籼稻主栽品种遗传多样性及变化趋势. 刘传光,张桂权. 2010

[4]利用SSR标记对高州野生稻遗传多样性的研究. 李晨,潘大建,毛兴学,涂从勇,周汉钦,范芝兰,李晓芳. 2005

[5]基于SSR标记的冬瓜种质资源遗传多样性分析. 焦贤贤,刘文睿,江彪,彭庆务,刘政国,谢大森. 2019

[6]用SSR标记分析高州野生稻的遗传多样性. 李晨,潘大建,毛兴学,涂从勇,周汉钦,范芝兰,李晓方. 2006

[7]利用SSR标记分析甘蔗重要亲本粤农73-204及其衍生品种的遗传多样性. 王丽,张剑亮,王继华,曹干. 2015

[8]基于SSR标记的芋头种质资源遗传多样性分析及抗疫病鉴定. 郭巨先,吴廷全,李沐蓉,唐康,姚春鹏,李桂花,罗文龙,王瑞. 2022

[9]黄瓜种质资源农艺性状多样性分析. 陈林,曹振强,梁肇均,何晓明,王敏,刘文睿,彭庆务,林毓娥. 2021

[10]91份广东桑四倍体种质资源的农艺性状遗传多样性分析. 王振江,罗国庆,戴凡炜,肖更生,唐翠明. 2015

[11]菜心种质资源遗传多样性的SRAP分析. 李桂花,陈汉才,张艳,温艺敏,陈琼贤,张桂权. 2012

[12]芥蓝种质资源遗传多样性的SRAP分析. 李桂花,陈汉才,张艳,郭凤仪,李向阳,刘振翔,张桂权. 2011

[13]应用SSR和ISSR标记分析栽培香稻品种的遗传多样性. 王金花,罗文永,陈建伟,刘元风,吴秋花,李晓方. 2005

[14]基于SRAP标记的白鹤芋属资源鉴定与亲缘关系分析. 刘小飞,廖飞雄,李冬梅,刘晓荣. 2017

[15]小白菜种质遗传多样性与亲缘关系的SRAP和SSR分析. 李桂花,陈汉才,张艳,黎庭耀. 2017

[16]广东省大豆种质资源遗传多样性分析及DNA分子身份证构建. 李清,罗永坚,吴柔贤,贾俊婷,张文虎,宋松泉,刘军. 2020

[17]华南地区樱桃番茄表型性状遗传多样性分析及综合评价. 李艳红,聂俊,郑锦荣,谭德龙,张长远,史亮亮,谢玉明. 2021

[18]广东苦茶资源嘌呤生物碱含量分析与评价. 李红建,秦丹丹,姜晓辉,方开星,王秋霜,潘晨东,李波,王青,吴华玲. 2021

[19]基于8个农艺性状的569份果桑种质遗传多样性分析. 王振江,罗国庆,戴凡炜,肖更生,林森,李智毅,唐翠明. 2021

[20]新品种丰秀占的选育及其栽培技术要点. 黄道强,周少川,李宏,卢德城,赖穗春,王志东,周德贵,付崇允. 2008

作者其他论文 更多>>