文献类型： 中文期刊

作者： 江珊 ¹ ; 李秀丽 ¹ ; 李富强 ¹ ; 李程 ¹ ; 陈建飞 ² ; 张莉 ¹ ; 任卫科 ¹ ; 朱琪 ¹ ; 冯力 ² ; 鄢明华 ¹ ;

作者机构： 1.天津市农业科学院畜牧兽医研究所

2.兽医生物技术国家重点实验室

关键词： 猪德尔塔冠状病毒;IPEC-J2细胞;转录组测序;细胞自噬;病毒复制

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 320-331

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）感染宿主细胞后诱导细胞中发生的自噬相关变化，建立了PDCoV感染IPEC-J2细胞模型，通过间接免疫荧光和荧光定量PCR试验确定PDCoV在细胞中显著增殖。利用转录组测序获得了IPEC-J2细胞感染模型和正常细胞中的全部表达基因15 393个。通过基因覆盖度和测序饱和度分析明确数据符合分析要求后，进一步筛选了PDCoV感染导致表达量发生显著变化的基因（差异基因）2 056个，其中自噬相关基因33个。采用荧光定量PCR方法检测12个自噬基因在细胞感染模型和正常细胞中的相对表达量，检测结果与高通量测序结果一致。通过GO功能和KEGG通路富集分析，明确差异基因主要富集的功能和信号通路，并重点展示了6条自噬相关信号通路。本研究初步展示了PDCoV在IPEC-J2细胞增殖过程中诱导细胞发生的自噬相关变化，为研究PDCoV通过诱导细胞自噬促进自身复制的分子机制提供了理论依据。