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基于cox Ⅰ、ITS和rbcL基因序列的马尾藻系统进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姚丹丹 1 ; 陈佐 2 ; 朱军 2 ; 邹潇潇 2 ; 穆丹 1 ; 鲍时翔 2 ;

作者机构： 1.佳木斯大学生命科学学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 马尾藻(Sargassum);遗传进化;cox Ⅰ;ITS;rbcL

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 004 期

页码： 1153-1162

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以海南省青葛港马尾藻属(Sargassum spp.)为研究对象,利用cox Ⅰ(细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ)、ITS(内转录间隔区)序列及rbcL(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基)3种DNA条形码分析马尾藻属遗传进化关系.结果表明,(1)基于形态鉴定及利用cox Ⅰ、ITS和rbcL三种DNA条形码进行分子鉴定的方式鉴定出9种海南省青葛港常见马尾藻属物种;(2)利用rbcL基因扩增出DNA序列的GC含量最低(32%),ITS基因扩增的DNA序列GC含量最高(59%),且在不同样本间ITS扩增的DNA序列GC含量差异最大,在57%~59%之间;(3)cox Ⅰ条形码序列可聚为两类,其中6个几乎不存在遗传距离,且5个样本间的遗传距离均小于50;从rbcL条形码序列的聚类结果看来,除了 RQL3之外,其他样品聚为一类,6个样本间的遗传距离均小于50.ITS条形码序列聚类的结果显示,9种马尾藻样本可聚为两类,马尾藻样本之间均存在一定的遗传距离.研究认为,青葛港海域马尾藻种内变异丰富,同一属的样品表现出很好的属内种间多样性;在分析青葛港马尾藻的遗传进化时利用ITS基因比其他两种基因能发现更多的遗传变异,能有效分析马尾藻的遗传进化关系.该研究结果对研究马尾藻种群生长和遗传进化具有重要现实意义,可为人工培育优异马尾藻属及其选育打下基础.

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