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海南特有极小种群植物文昌锥的SCoT-PCR体系建立及有效引物评价

文献类型: 中文期刊

作者: 杨立荣 1 , 2 ; 孙秀秀 1 , 2 ; 陈加利 1 , 2 ; 云勇 1 , 2 ; 陈宣 1 , 2 ; 郑道君 1 , 2 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院热带园艺研究所

2.海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室

关键词: 文昌锥;SCoT;反应体系优化;有效性引物

期刊名称: 植物研究

ISSN: 1673-5102

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 66-72

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了应用SCoT分子标记研究文昌锥种质资源,通过单因素试验和正交试验2种方法,分析DNA、引物、d NTPs、Taq DNA聚合酶这4种因素对文昌锥SCoT-PCR扩增结果的影响,优化建立文昌锥SCoT-PCR体系,并对文昌锥SCo T标记引物进行有效性评价。结果表明:各个因子对SCoT-PCR扩增影响大小依次为:DNA> d NTPs>引物> Taq DNA聚合酶;最优反应体系为:总体系为20μL,DNA含量为2.5 ng,引物浓度为0. 8μmol·L~(-1),d NTPs浓度为0. 2 mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶的含量1 U;经验证,该体系获得的扩增产物清晰、稳定;应用该体系筛选出15条多态性好且适合文昌锥扩增的引物,为今后利用SCo T分子标记技术对文昌锥及其他壳斗科植物进行相关研究提供技术支持。

  • 相关文献

[1]榴莲蜜基因组DNA提取方法比较及SCoT反应体系的优化. 崔健,胡福初,陈哲,郭利军,段恋. 2017

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