您好，欢迎访问青海省农林科学院 机构知识库！
青海省农林科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

基于转录组序列的芜菁SSR标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 李晓娟 1 ; 赵文菊 1 ; 赵孟良 1 ; 邵登魁 1 ; 马一栋 1 ; 任延靖 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院

关键词： 芜菁;分子标记;转录组;遗传多样性

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2023 年 35 卷 002 期

页码： 319-328

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究芜菁(Brassica rapa L.)种质资源的多样性水平,本研究采用转录组测序的方法挖掘芜菁的SSR分子标记.结果表明:转录组测序分析共获得了253720条unigene,其中13247条unigene序列中含有2个或2个以上SSR位点,SSR的发生频率为25.05%,平均每3.15 kb出现1个SSR,分布频率为31.42%.30对引物最终均获得了多态性高、条带清晰的结果,共扩增出多态性条带有126条,平均每对引物扩增出4.2条,平均多态率100%.根据电泳检测扩增结果,最终得到24对多态性高、条带清晰的芜菁SSR引物,24对SSR引物在50份芜菁材料中共扩增获得了101个等位基因,平均每个位点等位基因数4.21个,分析显示,平均有效等位基因数(Ne)为1.4817个,有效等位变异率为35.19%,这些结果表明,筛选出的引物能较好地表现50份芜菁的遗传多样性,同时对于更多芜菁品种的DNA指纹图谱构建和杂交种鉴定均具有重要意义.

  • 相关文献

[1]19份芜菁种质资源地下部性状的遗传多样性分析. 韩睿,赵孟良,孙世英,田丰,任延靖. 2020

[2]41份西北芥菜型油菜遗传多样性的AFLP分析. 姚艳梅. 2015

[3]青海白菜型油菜资源遗传多样性分析. 赵志,唐国永,余青兰,姚艳梅,李钧. 2019

[4]不同芜菁种质资源营养成分分析及评价. 任延靖,赵孟良,韩睿. 2021

[5]芜菁实时荧光定量PCR内参基因筛选. 任延靖,韩睿,赵孟良. 2021

[6]不同芜菁种质资源营养品质分析及综合评价. 马一栋,李晓娟,赵孟良,张海旺,韩睿,赵家兴,赵凤,任延靖. 2021

[7]基于菊芋转录组的SSR分子标记开发及鉴定. 杨世鹏,孙雪梅,王丽慧,高洁铭,李莉,田洁,赵孟良,钟启文. 2018

[8]甘蓝型油菜种子发育灌浆后期的转录组分析. 熊辉岩,段瑞君,王瑞生,孟庆志. 2018

[9]枸杞转录组SSR分布特征分析及其与基因组SSR分布特征的比较. 虞杭,张得芳,樊光辉,王占林. 2018

[10]基于转录组的黑果枸杞SSR分布特征分析及引物设计. 郝广婧,祁银燕,张得芳,朱春云. 2019

[11]大蒜转录组简单重复序列标记分析与分子标记开发. 刘新雨,田洁. 2020

[12]基于人参果转录组测序的SSR和SNP特征分析. 陈姝欣,朱浩东,杨梦思,陶连德,钟启文,杨世鹏. 2020

[13]PEG胁迫下春小麦苗期叶片的转录组分析. 杨文君,叶景秀,李生荣,马宏. 2020

[14]基于转录组的唐古特白刺密码子偏好性分析. 张得芳,夏涛. 2021

[15]基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析. 蒋礼玲,陈丽华,尼玛扎西,马晓岗,黄胜雄,李高原. 2021

[16]基于转录组和代谢组解析香瓜茄果实类黄酮代谢差异. 司诚,杨世鹏,孙祝,张广楠,钟启文. 2023

[17]基于转录组测序的柴达木地区枸杞根腐病发病机理研究. 方泰军,侯璐,白露超. 2022

[18]以半冬性甘蓝型油菜为亲本增强春性甘蓝型油菜杂种优势. 姚艳梅,柳海东,徐亮,杜德志. 2013

[19]青海大黄油菜粒色性状分子标记的开发和图谱整合. 赵会彦,肖麓,赵志,杜德志. 2014

[20]青稞Wx基因多态性与直链淀粉含量的关系. 吴昆仑,赵媛,迟德钊. 2012

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：青海省农林科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台