文献类型: 中文期刊
作者: 高洁铭 1 ; 杨世鹏 1 ; 王丽慧 1 ; 张亚琦 1 ; 王艳萍 2 ; 孙雪梅 1 ;
作者机构: 1.青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室
2.青海大学农牧学院
关键词: 菊芋(Helianthustuberosus L.);1-SST;基因克隆;生物信息学分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2020 年 18 卷 024 期
页码: 8039-8046
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 果聚糖是菊芋的主要贮藏物质,其代谢与产量形成和逆境适应性密切相关.为了解菊芋果聚糖合成代谢的机制,本研究以'青芋1号'为研究对象,利用同源克隆方法,对果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析.结果表明,1-SST基因全长为3 925 bp,CDS大小为1 890 bp,由5个内含子和6个外显子组成.经生物信息学分析,预测1-SST蛋白分子量70 934.40 Da,等电点5.10,有两个属于糖基水解酶32家族的保守区,属于亲水性蛋白,以延伸结构(24.48%)和无规则卷曲(56.76%)为主要二级结构,在质膜外行使功能.系统进化分析表明,菊芋1-sST基因与向日葵遗传距离最近,与龙舌兰等不同科不同属的植物进化距离较远.本研究基于对菊芋中调控果聚糖合成代谢1-SST基因的克隆与生物信息学分析,为高等植物果聚糖代谢途径研究奠定一定的理论基础.
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