文献类型: 中文期刊
作者: 黄丽丽 1 ; 张艳 1 ; 刘海隆 1 ; 林哲敏 1 ; 谭树义 1 ;
作者机构: 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词: 五指山猪;TLR4基因;克隆;生物信息学分析
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2019 年 47 卷 008 期
页码: 41-46
收录情况: 北大核心
摘要: 为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征,以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列,采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析.结果显示,获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10435 bp,其中编码区全长2526 bp,共编码841个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比,存在38处突变(其中有2处突变位于编码区);与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9% 、80.7% 、79.9% 、74.8% 、74.7% 、73.1% 、73% 、72.7% 、62.5% 、43.4%;五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白,具有亲水性,有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点;氨基酸系统进化树分析表明,不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性.该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础.
- 相关文献
[1]海南五指山猪TLR2基因克隆及生物信息学分析. 张艳,黄丽丽,刘海隆,林哲敏,谭树义. 2017
[2]海南五指山猪Myf5基因克隆与序列分析. 晁哲,王峰,魏立民,孙瑞萍,黄丽丽,郑心力. 2014
[3]五指山猪FSHβ基因克隆测序及生物信息学分析. 郑心力,刘海隆,黄丽丽,孙瑞萍,晁哲. 2016
[4]海南五指山猪FUT2基因SNP检测及生物信息学分析. 晁哲,孙瑞萍,刘海隆,黄丽丽,郑心力,王峰. 2017
[5]五指山猪FUT1基因SNP检测及生物信息学分析. 晁哲,王峰,黄丽丽,刘海隆,孙瑞萍,郑心力. 2015
[6]五指山猪SLA-DQA和SLA-DQB基因SNP检测及生物信息学分析. 晁哲,李娇伦,秦烨,王峰,郑心力. 2017
[7]五指山猪生长激素基因全序列克隆及序列分析. 林莉,欧江涛,郭春华,黄礼光,王希龙. 2007
[8]五指山猪IGF-1基因部分序列的SNP分析. 王峰,孙瑞萍,魏立民,郑心力,张艳. 2010
[9]浅谈五指山猪保种现状、存在问题及对策. 黄丽丽. 2007
[10]海南五指山猪Myf5与MyoD基因多态性分析. 吴淑疆,晁哲. 2015
[11]海南五指山猪生长发育性能测定研究. 王峰,魏立民,郑心力,孙瑞萍. 2009
[12]海南五指山猪生长发育性能测定试验. 王峰,魏立民,郑心力,孙瑞萍. 2009
[13]海南地方猪POU1F1基因多态性与体质量的相关性. 孙瑞萍,魏立民,郑心力,刘圈伟,黄丽丽,晁哲,王峰. 2012
[14]海南原产地五指山猪生理生化指标测定. 孙瑞萍,王峰,魏立民,刘圈伟,郑心力. 2011
[15]MC4R基因多态性在海南地方猪中的分布. 晁哲,魏立民,孙瑞萍,刘海隆,刘圈炜,王峰,郑心力. 2014
[16]五指山猪IGF2基因5'调控区单核苷酸多态性分析. 常怀普,欧江涛,钟金城,王希龙,郭春华,宾石玉,马志杰. 2007
[17]雌激素受体基因多态性在海南地方猪中的分布. 叶玉秀,孙瑞萍,刘海隆,晁哲. 2016
[18]转Bt玉米对生长期五指山猪血清生化指标及相关酶含量的影响. 刘圈炜,谭树义,孙哲,张宏福,杨晓光. 2013
[19]海南原产地五指山猪资源保护与开发利用. 孙瑞萍,魏立民,晁哲,王峰. 2015
[20]地衣芽孢杆菌对断奶五指山猪生产性能、血清生化指标及免疫指标的影响. 魏立民,刘圈炜,刘海隆,郑心力,王峰. 2017
作者其他论文 更多>>
-
五指山猪与临高猪杂交利用效果研究
作者:王峰;孙瑞萍;晁哲;刘海隆;刘圈炜
关键词:
-
海南黑山羊及其F1代杂交羊背最长肌转录组测序比较分析
作者:晁哲;任钰为;孙瑞萍;魏立民;刘海隆;邢漫萍;黄丽丽;王峰
关键词:海南黑山羊;努比亚山羊;背最长肌;基因;长链非编码核糖核酸;靶基因
-
五指山猪骨骼肌全基因组甲基化鉴定与分析
作者:张庆玲;任钰为;孙瑞萍;刘海隆;王峰;李丹丹;晁哲
关键词:五指山猪;背最长肌;半腱肌;全基因组;甲基化
-
海南黑山羊与其F1代杂交羊皮下脂肪转录组测序比较分析
作者:晁哲;任钰为;孙瑞萍;魏立民;刘海隆;邢漫萍;黄丽丽;郑心力
关键词:海南黑山羊;皮下脂肪;基因;信使RNA;长链非编码RNA
-
粗纤维水平对定安鹅胸肌纤维性状及肉品质的影响
作者:刘圈炜;林大捷;邢漫萍;孙瑞萍;黄丽丽;魏立民
关键词:粗纤维水平;定安鹅;肌纤维特性;肉品质;营养成分
-
五指山猪和长白猪断奶仔猪肠道免疫性能及微生物多样性比较分析
作者:张婷;魏立民;刘光亮;王峰;晁哲;任钰为;刘海隆;郑心力;黄丽丽;孙瑞萍
关键词:五指山猪;长白猪;早期断奶;免疫性能;肠道微生物多样性
-
低蛋白质饲粮添加支链氨基酸对生长前期海南猪体尺指标和抗氧化指标的影响
作者:魏立民;刘圈炜;晁哲;黄丽丽;邢漫萍;王峰;郑心力;孙瑞萍
关键词:低蛋白质饲粮;支链氨基酸;海南猪;体尺指标;抗氧化指标