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南美白对虾体表与肠道细菌菌群结构的DGGE分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张云鹏 1 ; 朱立颖 2 ; 肖朝耿 3 ; 唐宏刚 3 ; 陈黎洪 3 ; 王欣 2 ; 顾青 1 ;

作者机构: 1.浙江工商大学食品与生物工程学院

2.浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所

3.浙江省农业科学院食品科学研究所

关键词: 南美白对虾;肠道菌群结构;体表菌群结构;DGGE

期刊名称: 中国食品学报

ISSN: 1009-7848

年卷期: 2016 年 16 卷 08 期

页码: 218-224

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用DGGE技术对南美白对虾体表与肠道的4个部位进行细菌菌群结构分析,结果表明:粪肠球菌和假单胞菌属是南美白对虾肠道细菌的主要成员;葡萄球菌属是体表的优势菌,尤其在腹部占据了绝对优势,包含3个菌种:表皮葡萄球菌、科氏葡萄球菌和巴氏葡萄球菌。不同部位的体表细菌存在差异,头胸部的葡萄球菌比腹部少,只有科氏葡萄球菌,而粪肠球菌与希瓦氏菌比腹部的多。头胸部有鳃,而腹部存在甲壳节与节的连接膜,这些生理结构的差异导致体表细菌菌群结构不同。DGGE图谱还揭示出一些常见的腐败菌分布是不同的,拟态弧菌和豚鼠气单胞菌只存在与肠道中,而希瓦氏菌属仅在体表被检测到。假单胞菌属的不同菌种在南美白对虾的体表与肠道有不同分布,DGGE甚至能检测到出现在体表与肠道的粪肠球菌的菌株不同。这些结果表明DGGE在菌株鉴定方面具有很高的灵敏性,有可能应用在腐败菌溯源方面。

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