科研产出
基于灰色关联与主成分聚类分析综合评价37份长荚豇豆种质资源
《广东农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]充分挖掘并利用长荚豇豆种质资源.[方法]对37份长荚豇豆种质资源的11个农艺性状进行主成分分析、聚类分析和灰色关联分析.[结果]37份长荚豇豆种质资源的农艺性状变异系数为7.99%~42.02%,其中荚长、荚横径变异系数最小(<10%),性状最稳定;其他9个农艺性状变异系数均>10%,可作为选育与改良品种农艺性状的首选.11个农艺性状通过主成分分析可以转化成6个主成分,其中特征值前6个主成分累计贡献率为87.17%,能代表37份长荚豇豆种质资源特征.37份长荚豇豆种质资源在遗传距离为10时可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ共3类,其中Ⅰ类28个品种,Ⅱ类5个品种,Ⅲ类4个品种,以Ⅲ类表现较好,分别是和顺、南滨708-K、鸿丰708、汉美八号,可作为在海南进行推广种植的品种.采用加权灰色关联分析法得到综合关联度最大为和顺,关联度0.7285,表现最优.经对比发现,加权灰色关联分析法与主成分分析法筛选出来的表现较优的品种基本相同.[结论]通过以上两种方法获得品质较好的10个种质资源中有6个相同,分别是和顺、瑞祥贵、南滨708-K、将军708、汉美七号、汉美八号,相同度达60%,表明这两种方法均可对种质资源进行评价并筛选出优良种质资源.
关键词： 长荚豇豆;农艺性状;主成分分析;聚类分析;灰色关联分析
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嫁接和施氮量对冬瓜干物质、氮素积累及其氮代谢酶的影响
《热带作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究通过开展嫁接栽培与施氮量对冬瓜干物质、氮素累积及其氮代谢酶的影响,明确冬瓜干物质、氮素积累动态规律和氮素吸收利用规律,旨在为冬瓜科学施肥提供理论依据.试验以'铁柱2号'冬瓜和'海砧1号'砧木为材料,试验为裂区设计,主区为栽培方式,分别为嫁接栽培和自根栽培2种栽培方式;副区为氮肥施用量,分别设置N0(0 kg/hm2)、N180(180 kg/hm2)、N360(360 kg/hm2)、N540(540 kg/hm2)4个处理,研究不同处理冬瓜在5个不同生育期氮素和干物质积累量及其氮代谢酶活性.冬瓜氮素和干物质积累总量随着施氮量的增加呈先升后降的趋势,在N360达到最大值,且显著高于其他3个施氮量处理;整个生育期嫁接冬瓜氮素和干物质积累总量分别较自根冬瓜提高了16.11%和11.76%,差异达到显著水平.冬瓜氮素和干物质积累的最大理论值(K)、最大积累速率(Vmax)和平均积累速率(Vmean)、快速积累期起始时期(T1)、快速积累期终止时期(T2)和最大积累速率出现时间(Tmax)均随着施氮量的增加呈先增后降趋势,在N360处理时达到最大值;嫁接栽培能显著提高冬瓜氮素和干物质的最大理论值(K)、最大积累速率(Vmax)和平均积累速率(Vmean).冬瓜硝酸还原酶(NR)和谷氨酰胺合成酶(GS)的活性随着生育期呈先增后减的趋势,在75 d(果实发育前期)达到最大值;此时NR和GS的活性均随着施氮量的增加呈现出先升后降的趋势,在N360达到最大值,且显著高于其他3个处理.嫁接栽培能显著提高冬瓜全生育期NR和GS,与自根冬瓜相比,嫁接冬瓜在30、55、75、95、110 d的NR活性分别提高了33.08%、28.95%、34.63%、36.03%和67.23%;而GS活性分别提高了29.64%、22.11%、21.00%、28.00%和35.27%.综上所述,嫁接栽培能显著影响干物质、氮素的积累总量及其累积速率以及NR和GS的活性.N360(360 kg/hm2)是冬瓜生产中适宜的氮肥施用量.
关键词： 冬瓜;施氮水平;嫁接栽培;氮素累积量;干物质累积量;氮代谢酶
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'台农17号'菠萝组培再生体系的建立
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为建立‘台农17号’菠萝组培再生体系，以‘台农17号’菠萝增殖单芽为试验材料，研究不同激素处理对愈伤组织诱导、增殖、再生和不定芽增殖及生根的影响。结果表明暗培养条件下，愈伤组织诱导效果最好的培养基是MS+6-BA 3.0 mg/L+NAA 2.0 mg/L,4周内愈伤组织诱导率高达92%，愈伤组织重量达1.49 g；在此基础上分别添加2,4-D、KT、ZT后，效果最好的是添加2,4-D浓度0.20 mg/L处理，愈伤组织长势明显提升，重量值达到最高的1.73 g，而添加KT和ZT愈伤组织增殖效果和长势未得到显著提升；光照培养条件下，愈伤组织再生最佳配方是MS+6-BA 2.0 mg/L+NAA 2.0 mg/L，再生率达到82%;MS+6-BA 2.0 mg/L+NAA3.0 mg/L适宜不定芽增殖，4周后增殖系数达5.40；生根配方1/2MS+IBA 0.5 mg/L+NAA 0.50 mg/L生根效果最佳，平均生根条数约3.87条，生根率95%。研究明确了不同激素及配比对‘台农17号’菠萝愈伤组织诱导、增殖、再生和芽增殖及生根的影响，初步建立了‘台农17号’菠萝高效组培再生技术体系，为深入研究菠萝开花机理提供了良好基础。
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丝瓜CONSTANS基因家族鉴定和表达分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：丝瓜是典型的短日照植物,光周期是影响其产量和品质的关键因素.CONSTANS(CO)是调控植物光周期成花转变的关键基因.本研究以海南主栽品种'泰利大肉丝瓜'为研究对象,利用生物信息学技术对CO基因家族进行鉴定分析,并研究CO基因在不同光周期处理下的表达模式.结果表明,丝瓜中含有6个CO基因,编码的多肽链长度为321~402个氨基酸,蛋白分子量为34.95~46.54 kD,理论等电点为4.49~7.65.进化分析表明CO基因家族分为三类,每个类别蛋白的保守基元数量相同,基因中具有相似的内含子/外显子结构.LcCO蛋白均含有保守的CCT和B-box保守结构域.丝瓜LcCO启动子区域含有大量与光响应相关元件.利用实时荧光定量PCR技术发现LcCO1和LcCO5基因的表达与光周期反应呈正相关,LcCO3基因的表达与光周期反应呈负相关.本研究初步筛选出丝瓜开花生物钟调控的潜在基因,对调控丝瓜开花节律具有重要意义.
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复合型涂膜剂对莲雾保鲜效果主成分分析综合评价
《食品科学 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：莲雾采后易失水引发劣变，本研究以多菌种培养液和壳聚糖配制3种复合型涂膜剂，在对采后莲雾8个品质指标单独分析基础上，结合主成分分析（principal component analysis,PCA）法和数学模型综合评价3种复合型涂膜剂的保鲜效果。结果表明，由乳酸菌培养液（V（乳酸链球菌）∶V（婴儿双歧杆菌）∶V（动物双歧杆菌）=1∶2∶2）和壳聚糖溶液按体积比3∶7配制的涂膜剂3保鲜效果最好，使用涂膜剂3的莲雾在贮藏第10天好果率达95%，比对照组高45%。涂膜剂处理能有效减少失水现象，在贮藏第10天，使用涂膜剂1、2、3莲雾的失水率分别为14.87%、13.81%、15.64%，均显著小于同期对照组（P＜0.05）。涂膜剂还能更好地维持莲雾品质稳定，使用涂膜剂3处理的莲雾经过10 d贮藏后，其可溶性固形物和可滴定酸质量分数比第0天分别增长了0.08%和12.28%，增幅最小，VC、葡萄糖、果糖含量比第0天分别降低了18.87%、10.91%、5.84%，降幅最小。PCA结果表明，PC1和PC2代表了8个指标的69.814%信息，能综合反映涂膜剂对全部指标的整体影响情况。数学模型分析表明，第0天莲雾综合得分为-0.53，贮藏第4天时，对照组得分由负转正，说明品质明显发生劣变。涂膜剂3处理的莲雾贮藏期间综合得分一直在临界值0附近，再次验证了其保鲜效果最好。保鲜效果排序为涂膜剂3＞涂膜剂1＞涂膜剂2＞对照组。本研究可为莲雾采后保鲜和品质综合评价提供参考。
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五指山猪和杜洛克猪全基因组选择信号差异分析
《畜牧兽医学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：旨在探究五指山猪和杜洛克猪免疫和脂质代谢相关基因的选择信号差异。本研究从海南国家级五指山猪保种场采集30头4月龄健康（10公，20母）五指山猪的耳组织进行全基因组重测序（whole genome sequencing, WGS）,从NCBI数据库下载29头杜洛克猪全基因组重测序数据（SRA:PRJNA378496）;通过生物信息学方法分析59个样本WGS数据的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNPs）,进行SNPs过滤，定位SNPs在基因组的位置，分析其结构特征和基因型频率，并注释对应基因的功能；使用XP-CLR方法筛选五指山猪基因组受到强烈选择的区域，分析两个品种相关通路基因的功能差异。结果表明，五指山猪平均每个样本共筛选到36 961 902个SNPs位点，内含子区域分布最多，平均每个样本16 729 364个，约占45.26%,编码区（起始、终止密码子）平均有2 073个SNPs;五指山猪受选择的基因组区域主要集中在免疫、代谢和神经功能相关通路；免疫反应通路中，9个基因（TGFBR2、IL26、IL15、BMPR2、TNFSF15、TNFSF4、TNFSF8、ACKR4、TNFRSF11B）功能区域SNPs位点在五指山猪中只存在一种突变纯合基因型，而在杜洛克猪大部分个体中存在3种基因型（野生纯合基因型、杂合子、突变纯合基因型）,其中野生纯合基因型比例最高；脂类代谢通路中，关键调节基因IRS2、PRKG1、ADCY5的基因型频率与免疫反应基因类似。在五指山猪中突变纯合基因型比例为100%,在杜洛克猪中野生纯合基因型所占比例为48%～93%（14/29-27/29）。本研究筛选出与五指山猪免疫性状相关的候选基因9个、与脂类代谢相关的候选基因3个，发现五指山猪免疫、代谢和神经功能相关基因的受选择程度强于杜洛克猪，为揭示五指山猪特色性状形成的分子机制提供参考。
关键词： 五指山猪 全基因组重测序 单核苷酸多态性 XP-CLR选择信号 炎症因子 脂类代谢
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不同砧木材料嫁接冬瓜苗期氮营养特性综合评价
《热带作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：评价冬瓜砧木的氮素营养效率,解决冬瓜氮肥施用过量的问题。以‘铁柱168’为接穗,获得11种嫁接苗,以自根苗为对照,分别在低氮(0.5 mmol/L)和正常氮(14.0 mmol/L)水平下进行水培试验,测定11种砧木材料的嫁接冬瓜苗期的植株干物量、氮含量和氮素累积量等指标。通过主成分分析计算嫁接苗与自根苗在正常氮和低氮水平下的氮效率综合值,并由聚类分析将砧木材料进行氮素营养效率的划分。结果表明,除正常氮水平下的根干物量小于低氮水平外,植株氮含量、氮积累量、茎干物量、叶干物量、地上部干物量和整株干物量均大于低氮水平;氮积累量和干物量为氮效率评价的最主要指标,其中正常氮水平下主要与茎、叶的干物量和氮积累量有关,低氮水平下主要与根、茎、叶干物量及其氮积累量有关;正常氮水平下,黑杆为氮高效型,‘京欣砧1号’和‘301’为氮低效型,‘海砧1号’‘冬砧1号’‘黄砧1号’‘雪藤木’‘铠甲’‘果砧2号’‘京欣砧2号’和‘京欣砧5号’为氮中效型;低氮水平下,‘京欣砧1号’为氮高效型,‘黄砧1号’和‘铠甲’为氮低效型,‘海砧1号’‘冬砧1号’‘雪藤木’‘301’‘黑杆’‘果砧2号’‘京欣砧2号’和‘京欣砧5号’为氮中效型。当前"一控两减三基本"的背景下,推荐选用‘京欣砧1号’作为冬瓜的嫁接砧木。
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芽孢杆菌Ya-1诱导辣椒防御酶活性提高和相关抗病基因的表达
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：芽孢杆菌Ya-1对辣椒枯萎病有较好的防治效果.为明确其是否具有诱导辣椒抗枯萎病的能力,本研究采用"浸根+灌根"法接种辣椒幼苗,分析不同处理前后辣椒叶片苯丙氨酸解氨酶(PAL)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)的活性及丙二醛(MDA)含量的变化.同时,RT-PCR分析了抗性相关蛋白PR-1、POD酶和SOD酶合成相关基因POD和SOD1的转录表达情况.结果表明,Ya-1处理后辣椒叶片PAL、POD和SOD活性较处理前显著上升,而MDA含量显著下降;抗性相关蛋白PR-1、防御酶相关基因POD和SOD1表达水平明显上调.本研究说明诱导辣椒产生抗病性是Ya-1防治辣椒枯萎病的机理之一.
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99份长荚豇豆种质资源及其枯萎病抗性相关分析研究
《种子 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为充分挖掘与利用长荚豇豆种质资源,筛选优质且抗枯萎病的豇豆种质,试验收集了99份长荚豇豆品种材料,采用主成分和聚类分析法、相关性分析以及灰色关联法,综合比对了99份长荚豇豆品种的23个农艺性状.结果表明,参试的99份长荚豇豆品种的变异系数大多大于10%,其中叶片含水率的变异系数最小,性状最稳定,而枯萎病田间发病率的变异系数最大,可作为豇豆抗病选育的方向.23个农艺性状可转化为10个主成分,10个主成分的累计贡献率为81.654%,能较好代替23个农艺性状来评价99份长荚豇豆品种.聚类分析结果表明,99份长荚豇豆材料在Euclidean距离为4.5时可分为四大类,其中Ⅱ类综合表现优良,抗病等级较高,适合推广种植,也可作为抗枯萎病育种材料,Ⅳ类抗枯萎病能力弱,不适合推广种植.综合主成分与灰色关联分析结果表明,南繁五号、林丰真如意、林丰如意三号、彩绿二号、泰国十一号、美美满满、翠深似海、吉丰608、F-1815和大富豪10个品种,豆荚性状表现优良,抗枯萎病能力强.
关键词： 长荚豇豆 抗枯萎病 主成分分析 聚类分析 灰色关联法
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以RNA聚合酶为靶点的抗槟榔黄化病毒药物虚拟筛选
《农药 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于槟榔黄化病毒的RNA依赖性RNA聚合酶筛选抗槟榔黄化病毒先导化合物.[方法]使用基于片段的药物设计方法,从PADFrag农药分子片段子库中筛选出14个片段作为骨架进行生长,得到140个分子,取11个CDOCKER得分靠前的分子进行分子动力学模拟和MM/GBSA计算以评估这些分子与RNA依赖性RNA聚合酶的亲和力,最后确定2个优选分子作为潜在的抗槟榔黄化病毒先导化合物.[结果]2个优选分子能以范德华力、静电相互作用以及氢键等方式与靶点稳固结合,有潜在的抗槟榔黄化病毒活性.[结论]2个优选分子可作为先导化合物用于新型抗槟榔黄化病毒药物开发.
关键词： 抗槟榔黄化病毒药物;RNA聚合酶;虚拟筛选;分子动力学模拟;MM/GBSA计算;药物设计
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