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乳中不同体细胞数的新疆褐牛STAT5B基因表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘攀 1 ; 姜徽 1 ; 巨星 1 ; 王丹 1 ; 田月珍 2 ; 付雪峰 2 ; 李媛媛 1 ; 苟穆荣 1 ; 王震 1 ; 樊琛 1 ; 布佐拉姑丽? 库尔班 1 ; 黄锡霞 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学动物科学学院

2.新疆维吾尔自治区畜牧科学院

关键词: 新疆褐牛;STAT5B;RT-qPCR;生物信息学分析;体细胞数

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2022 年 58 卷 002 期

页码: 106-112

收录情况: 北大核心

摘要: 新疆褐牛是我国育成的首个乳肉兼用牛品种,具有抗逆性强、体细胞数低、耐粗饲的优点,拥有西北第一牛的美称.前人研究发现,STAT5B基因与新疆褐牛的泌乳性状有关,为了进一步探索STAT5B基因对新疆褐牛泌乳性状的影响,通过采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对STAT5B基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量进行分析;同时使用NCBI Blast、ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODE、MEGA、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0 Server、WoLF PSORT等生物信息学分析软件对STAT5B基因编码的蛋白进行结构分析与功能预测.RT-qPCR结果表明:STAT5B基因对奶牛乳房炎影响不显著,但STAT5B基因在健康新疆褐牛血液中的表达量高于患乳房炎的新疆褐牛.生物信息学分析结果表明:STAT5B基因编码蛋白的分子式为C4006H6263N1111O1197S25,共编码787个氨基酸;进化树分析结果表明牛STAT5B基因与水牛的亲缘关系较为接近;经预测STAT5B基因编码的蛋白质是一种亲水性蛋白,主要由亮氨酸组成;该蛋白中α-螺旋高达50.95%,β-折叠的含量最少.该分析及预测结果主要为探索新疆褐牛STAT5B基因的功能奠定基础,为阐明其对新疆褐牛泌乳性状的影响提供了理论依据.

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