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两种凝胶电泳系统对SSR标记多态性的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 李新海 1 ; 焦少杰 2 ; 傅骏骅 1 ; 张世煌 1 ; 袁力行 1 ; 李明顺 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院作物育种栽培研究所

2.黑龙江省农业科学院育种研究所

关键词: 玉米;SSR标记;遗传变异;多态性信息量

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2001 年 16 卷 02 期

页码: 43-48

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用 35个SSR引物和 14个玉米自交系直接比较了 3%Metaphor琼脂糖凝胶和 12 %聚丙烯酰胺凝胶电泳对SSR位点多态性水平的影响。结果表明 ,两种凝胶系统检测出的等位基因数目和基因多态性水平存在显著差异 ,12 %聚丙烯酰胺凝胶在区分微小差异片段能力上明显高于 3%Metaphor琼脂糖凝胶。另一方面在两种电泳检测系统下 ,14个自交系之间的遗传相似系数相关性 (r =0 516)达到了极显著水平 (P <0 0 1)。在 10个具有最大多态性信息量的SSR引物中 ,8个在两种凝胶系统中保持相同。利用 8个引物可以对供试自交系进行初步鉴定。笔者认为 ,3%Metaphor琼脂糖凝胶电泳比较适合在遗传作图或基因定位研究中应用 ;而在品种指纹图谱分析或遗传多样性研究中 ,应采用 12 %聚丙烯酰胺凝胶电泳作为检测工具

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