文献类型: 中文期刊
作者: 陈紫岩 1 ; 林参 1 ; 尹航 1 ; 张豪杰 1 ; 魏真真 2 ; 余希文 1 ; 吴传万 1 ; 李茹 3 ;
作者机构: 1.江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所
2.四川省农业科学院植物保护研究所
3.苏州市农业科学院
关键词: 磷酸蔗糖磷酸酶(SPP);基因家族;藜麦;表达分析
期刊名称: 江西农业学报
ISSN: 1001-8581
年卷期: 2022 年 010 期
页码: 116-123
摘要: 为明确CqSPPs基因家族的进化关系,以公开的藜麦基因组数据库为基础,鉴定出4个CqSPP基因,并进一步明确了各成员结构及其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、模体和启动子。以现有高通量转录组数据为基础,明确了各成员在藜麦不同组织中的表达水平,并采用qRT-PCR对各成员在苗期不同逆境下的表达水平进行了检测。CqSPPs分布于4个不同的染色体上,将其命名为CqSPP1~CqSPP4,其蛋白氨基酸数目在399~623之间,分子量介于45.24~70.77 kDa之间,理论等电点在5.64~6.93之间,同时表现出明显的亲水性。亚细胞定位预测显示除了藜麦SPP2蛋白预测结果为不确定外,其余蛋白主要定位在叶绿体上。蛋白保守模体分析结果显示,在该基因家族编码蛋白中预测得到10种保守模体,其中所有蛋白均含有8个排列顺序相同的模体。系统发育分析显示,植物中SPP基因家族可以分为5个组,其中CqSPP基因处于其中的2个组,并且与拟南芥SPP基因亲缘关系最近。启动子分析显示,各成员在启动子区域存在多种响应非生物胁迫的顺式转录元件。表达分析显示CqSPP1在各组织中均明显表达,而CqSPP4在各组织中表达量较低。在受到不同胁迫时,SPP基因家族的响应情况各不相同。结果表明CqSPPs有4个成员,且受多种非生物胁迫诱导表达,推测其可能在藜麦响应非生物胁迫过程中发挥了重要作用。
- 相关文献
[1]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017
[2]藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析. 时丕彪,何冰,费月跃,王军,王伟义,魏福友,吕远大,顾闽峰. 2019
[3]大丽轮枝菌异分支酸水解酶基因家族初步研究. 袁洪波,刘蔼民,张保龙. 2012
[4]玉米Dof转录因子家族的全基因组鉴定与分析. 葛敏,吕远大,李坦,张体付,张晓林,赵涵. 2014
[5]棉花基因组中SABATH甲基转移酶 基因家族的查找与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2018
[6]玉米Glyco-hydro-16糖苷酶家族全基因组的鉴定及其遗传分化. 林峰,葛敏,周玲,赵涵. 2016
[7]棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2018
[8]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[9]斑点叉尾鮰Cbx基因家族的全基因组鉴定与进化分析. 张世勇,陈校辉,王明华,钟立强,秦钦,邵俊杰,刘洪岩,王江,边文冀,Jiang Hucheng. 2019
[10]棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2020
[11]基于苋菜转录组的TCP基因家族成员鉴定及表达分析. 安子贤,李宜轩,郑友峰,肖昉,王乐,陈何,赖钟雄,牟建梅,刘生财. 2022
[12]桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因鉴定和表达分析. 张春华,沈志军,马瑞娟,张圆圆,郭绍雷,蔡志翔,俞明亮. 2022
[13]猕猴桃蔗糖合酶基因家族鉴定及果实发育过程表达分析. 陈成,王依,杨勇,阎永齐. 2023
[14]植物氮素吸收利用相关NPF基因家族研究进展. 王化敦,张鹏,马鸿翔. 2022
[15]藜麦EST-SSR的开发及通用性分析. 张体付,戚维聪,顾闽峰,张晓林,李坦,赵涵. 2016
[16]藜麦的耐盐性评价及在滨海盐土的试种表现. 戚维聪,张体付,陈曦,王军,彭亚民,费月跃,顾闽峰,赵涵. 2017
[17]盐胁迫对藜麦种子萌发特性的影响. 时丕彪,李亚芳,耿安红,王军,王春云,彭亚民,顾闽峰,费月跃. 2017
[18]盐胁迫对不同藜麦品种发芽率及幼苗生长的影响. 顾闽峰,王乃顶,王军,费月跃,彭亚民,王伟义,时丕彪,马萌萌. 2017
[19]江苏沿海地区12个藜麦品种田间综合评价及优良品种的耐渍性分析. 时丕彪,耿安红,李亚芳,王军,王春云,彭亚民,顾闽峰,费月跃. 2018
[20]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022
作者其他论文 更多>>
-
高产抗病夏大豆新品种淮豆15的选育及栽培要点
作者:赵志鑫;傅蒙蒙;李曙光;王亚琪;余希文;杨加银;徐海风
关键词:淮豆15;夏大豆;选育;高产
-
大豆对遮阴胁迫的光合生理和农艺特性响应研究进展
作者:赵志鑫;傅蒙蒙;李曙光;王亚琪;余希文;杨加银;徐海风
关键词:大豆;耐阴性;带状复合种植
-
170份小麦高代品系品质性状的相关性分析和聚类分析
作者:张志鹏;李菁;王兴龙;林参;严卫古;朱明超
关键词:小麦;高代品系;品质性状;相关性分析;聚类分析
-
104个粳稻品种(系)的产量性状遗传多样性分析及优良种质资源筛选
作者:张志鹏;李菁;林参;王兴龙;严卫古;朱明超
关键词:水稻;产量性状;遗传多样性;聚类分析;主成分分析
-
淮安市农业科学研究院种业研发现状及对策研究
作者:魏杰;张豪杰;吴传万;章安康;彭杰
关键词:地市级农业科研院所;种业科技创新;种质资源;淮安市
-
纳米氧化物和溶磷真菌对盆栽水稻生物量和土壤有效磷含量的影响
作者:贾艳艳;徐建明;吴传万;顾大路;杨文飞;杜小凤;王伟中;诸俊
关键词:纳米氧化锌;土壤有效磷;磷酸酶活性;水稻生物量;溶磷真菌
-
氨基多糖水溶肥对小麦生理特性、产量及籽粒品质的影响
作者:杜小凤;顾大路;仲秀娟;梁双林;彭杰;杨文飞;吴传万
关键词:小麦;氨基多糖;生理特性;产量;籽粒品质