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玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3J的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李楠 1 ; 朱旭 1 ; 柳青 1 ; 郭嘉 1 ; 孙传波 1 ; 李传龙 1 ; 贺红利 2 ; 贺红霞 1 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院农业生物技术研究所吉林省农业生物技术重点实验室

2.吉林师范大学生命科学学院

关键词: 玉米(Zea mays);蔗糖转运蛋白;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 2111-2122

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 植物蔗糖转运蛋白是植物中特有的一类跨膜蛋白,负责蔗糖经韧皮部从源到库的运输以及库组织的蔗糖供给。为了解析单子叶特异的玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3的生物学功能,本研究利用RT-PCR方法,从玉米自交系‘吉853’的基因组中克隆得到蔗糖转运蛋白ZmSUT3基因,命名为ZmSUT3J。测序结果表明:开放阅读框(ORF)长度为12052720bp,编码508个氨基酸的蛋白质即ZmSUT3,分子量为53.5120kD。利用生物信息学的方法分析ZmSUT3蛋白属于疏水的MFS蛋白超家族,含有多个磷酸化位点,主要定位在质膜和叶绿体类囊体膜上,具有12个弯曲交叉的螺旋结构,属于跨膜蛋白。系统进化树分析表明,ZmSUT3蛋白属于SUT3亚族,与高粱的Sb20SUT3亲缘关系较近。启动子区域生物信息学分析结果显示,含有多个组织特异性调控元件,还有激素调节及胁迫诱导相关顺式作用元件,推测ZmSUT3在库组织中发挥作用,参与激素相关胁迫应答反应。为验证ZmSUT3J基因的生物学功能,本研究构建了植物表达载体,为研究ZmSUT3在玉米中的功能奠定了基础。

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