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百脉根WRKY基因家族生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 马培杰 1 ; 李亚娇 1 ; 舒健虹 1 ; 王小利 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院草业研究所

关键词: 百脉根;WRKY;基因家族

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2023 年 014 期

页码: 4606-4617

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: WRKY转录因子是一个超家族的调节因子,参与植物的多种生物过程和逆境胁迫反应。然而,在百脉根中对WRKY家族还没有相关的研究。本研究共鉴定出79个LjWRKYs基因,它们不均匀分布在各染色体上的基因位点编码,与拟南芥At WRKYs进行系统发育分析,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类。保守基序和外显子-内含子数目表明79个LjWRKYs在不同亚簇中均具有较大的差异,顺式作用元件结果显示在上游2 000 bp启动子区域包含多种逆境胁迫、激素和生长发育相关的元件。共线性结果有36对片段复制和1对串联重复复制共线性基因,且Ka/Ks均小于1。本研究通过分析百脉根WRKY基因家族的基本结构与性质,为深入研究百脉根WRKY基因家族提供了基础。

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