文献类型: 中文期刊
作者: 胡文萍 1 ; 董新龙 1 ; 田志龙 1 ; 汤继顺 1 ; 刘秋月 1 ; 王翔宇 1 ; 狄冉 1 ; 张效生 1 ; 张金龙 1 ; 王金玉 1 ; 储明星 1 ;
作者机构: 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室;扬州大学动物科学与技术学院;安徽省农业科学院畜牧兽医研究所;天津市畜牧兽医研究所
关键词: 绵羊;Izumo1基因;克隆;多态性;SNP;产羔数
期刊名称: 中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2020 年 01 期
页码: 95-104
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要:
为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点。同时,采用Sequenom MassARRAY~?技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究。结果表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135A>G和g.54412107C>A 2个位点。Izumo1基因g.54412135A>G位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107C>A在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(P<0.01);群体遗传学分析得出g.54412135A>G多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PIC<0.25);g.54412107C>A多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25
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