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野生茄子黄萎病病程相关基因StDAHP的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王忠 1 ; 谢超 1 ; 决登伟 1 ; 黄乐平 2 ; 黄全生 2 ; 杨清 1 ;

作者机构: 1.南京农业大学生命科学学院

2.新疆农作物生物技术重点开放实验室

关键词: Solanum torvum;StDAHP;克隆;表达分析

期刊名称: 中国生物工程杂志

ISSN: 1671-8135

年卷期: 2010 年 30 卷 06 期

页码: 48-53

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RACE和同源序列克隆技术,从野生茄子托鲁巴姆(Solanum torvum)中克隆得到一个DAHP同源基因,命名为StDAHP基因,提交至GenBank,登录号为GU479467。生物信息学分析表明:StDAHPcDNA含有一个1683bp的开放阅读框,编码一个由560个氨基酸残基组成的蛋白,该蛋白分子量为62.53kDa,等电点为9.1。采用DNAMAN软件对StDAHP和其他同源蛋白的氨基酸序列比对,结果表明:该蛋白与来自马铃薯、番茄、烟草和水稻4种植物的同源蛋白在氨基酸水平有较高的一致性;且在靠近N-末端和C-末端的氨基酸都比较保守。采用半定量RT-PCR方法对StDAHPmRNA水平进行了分析,结果显示:StDAHP属于诱导表达,在病原菌侵染后期维持较高水平。

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