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基于高通量测序筛选‘紫娟’花青素合成相关的miRNA

文献类型： 中文期刊

作者： 陈林波 1 ; 夏丽飞 1 ; 刘悦 1 ; 蒋会兵 1 ; 田易萍 1 ; 陈亮 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心/云南省茶学重点实验室;中国农业科学院茶叶研究所

关键词： 茶树;花青素合成;高通量测序;miRNA;靶基因

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 681-691

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选调控紫娟茶树花青素合成相关miRNA,以茶树品种紫娟(ZJ)、云抗10号(YK)和福鼎大白茶(FD)为材料,构建了miRNA文库。鉴定出46种已知的miRNAs和67种新的miRNAs,预测到具有注释的靶基因765个。通过差异表达分析,筛选出在ZJ与YK、ZJ与FD共有差异表达的miRNA24个。通过对24个差异表达miRNA的靶基因分析,筛选出可能参与调控花青素合成的miRNA 4个,包括miR828a、miR845c、novel_14和novel_87,其预测的靶基因包括转录因子基因MYB4、MYB23、MYB26、MYB82、bHLH74以及4-香豆酰辅酶A链接酶(4CL)、二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)和UDP-葡萄糖黄酮3-O-葡糖基转移酶(UFGT)等基因。利用RT-PCR分析8个差异表达的miRNA,其结果与转录组分析一致。本研究结果为进一步开展茶树花青素生物合成的调控机制研究奠定基础。

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