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云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"

文献类型: 中文期刊

作者: 武晓阳 1 ; 杨亚洲 2 ; 隆文杰 3 ; 陈丹 3 ; 周国雁 3 ; 杜娟 3 ; 伍少云 3 ; 蔡青 3 ; 黄兴奇 1 ;

作者机构: 1.云南大学生命科学学院

2.中国种子集团有限公司生命科学技术中心

3.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词: 糯玉米地方品种;四路糯;重测序;“124”转座子;起源演化

期刊名称: 安徽农业科学

ISSN: 0517-6611

年卷期: 2022 年 013 期

页码: 93-97

摘要: [目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息;通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列,并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息;在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点,这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致;B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中“124”一致的转座子序列;建立的系统进化树可将“124”转座子归为4种类型,其中并没有单一基因组来源的类型。[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异。

  • 相关文献

[1]云南不同来源四路糯玉米waxy和tb1基因分析. 武晓阳,隆文杰,陈丹,周国雁,杜娟,伍少云,蔡青. 2020

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