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水稻SBP基因家族的生物信息学分析(英文)

文献类型： 中文期刊

作者： 王翊 1 ; 胡宗利 2 ; 杨妤欣 3 ; 陈绪清 3 ; 陈国平 4 ;

作者机构： 1.重庆大学计算机学院

2.重庆大学生物工程学院

3.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心

4.重庆大学生物工程学院北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心

关键词： SBP-box;水稻;基因芯片;表达谱

期刊名称： 生物信息学

ISSN： 1672-5565

年卷期： 2011 年 09 卷 01 期

页码： 82-87+92

摘要： SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE(SBP)转录因子家族是植物特有的一类转录因子。本文确定了20水稻基因组上编码的SBP基因。通过分类,染色体定位,保守区确定,亲缘关系,以及水稻SBP家族中的重复基因及该家族成员形成蛋白二聚体的可能性进行分析,其次利用了Affymetrix水稻基因组芯片数据,对所有这些基因的表达谱进行了分析。结果表明,水稻SBP基因在花和种子的发育过程中可能发挥重要作用,而其对环境胁迫却不敏感。这对进一步研究SBP的功能提供了有价值的线索和思路。

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