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杏褪绿卷叶植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 艾克热木·买买提 1 ; 韩剑 1 ; 罗明 1 ; 唐章虎 1 ;

作者机构： 1.新疆农业大学农学院;新疆维吾尔自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室;新疆农科院轮台国家果树资源圃

关键词： 杏;杏褪绿卷叶病;植原体;16S rDNA;序列分析

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 186-192

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用植原体16S rDNA基因通用引物对新疆轮台县疑似杏褪绿卷叶病植株总DNA进行巢氏PCR检测,扩增出大小约1.2 kb的特异性条带。对扩增产物克隆和测序,确定特异片段大小为1 248 bp。序列同源性比较和系统进化分析表明,新疆杏褪绿卷叶植原体不同分离株16S rDNA基因序列同源性极高,达到99.8%～100%。与16SrⅤ组成员的同源性达到98.2%以上,其中与16SrⅤ-B亚组的枣疯病植原体山东宝山分离株,甜樱桃绿化植原体山东分离株同源性最高,达到99.4%～99.6%。进一步虚拟RFLP分析,结果表明该植原体属于榆树黄化组(16SrⅤ)的一个新的亚组,与其相似性最高的是16SrⅤ-B亚组,相似系数为0.94。本研究首次报道了新疆杏褪绿卷叶植原体16S rDNA的序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。

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[1]杏褪绿卷叶植原体新疆分离物核糖体蛋白基因的克隆与序列分析. 韩剑,+,陈杭,+,艾克热木·买买提,罗明,唐章虎. 2021

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[3]杏褪绿卷叶植原体新疆分离物可视化LAMP检测方法的建立. 韩剑,陈开文,纪文博,陈杭,唐章虎. 2020

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