文献类型： 中文期刊

作者： 李玉鹏 ¹ ; 李海花 ² ; 李义海 ¹ ; 王柳懿 ³ ; 郭晓飞 ¹ ; 张效生 ¹ ;

作者机构： 1.天津市农业科学院畜牧兽医研究所

2.天津农学院动物科学与动物医学学院/天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室

3.天津师范大学生命科学学院/天津市动植物抗性重点实验室

关键词： 丁酸梭菌;二元杂交;三元杂交;遗传差异;Toll样受体

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2021 年 021 期

页码： 8-14,149

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究丁酸梭菌对不同遗传背景断奶仔猪TLR2信号通路差异调控的分子机制,试验采用PCR方法从二元杂交黑猪和三元杂交白猪回肠中扩增出TLR2全基因,并对其进行克隆和鉴定;利用BioEdit软件分析两种仔猪TLR2基因与GenBank中人、黑猩猩、水牛、家牛、绵羊、马、藏羚羊和宽吻海豚8个物种的同源性;使用MEGA 4.0软件进行聚类分析,邻接法构建系统进化树;使用ProtParam、ProtScale和TMHMM在线工具分别预测分析蛋白质结构、疏水性和跨膜区,并应用DNAStar软件比较两种仔猪TLR2蛋白序列差异。结果表明:PCR扩增获得二元杂交黑猪和三元杂交白猪的TLR2全基因,大小均为2 358 bp,且目的基因正确连接到了pMD19-T载体中。二元杂交黑猪和三元杂交白猪TLR2基因序列与人、黑猩猩、水牛、家牛、绵羊、马、藏羚羊和宽吻海豚8个物种的同源性分别为78%～82%和79%～82%,亲缘关系较远,而两种仔猪在同一个分支内。二元杂交黑猪和三元杂交白猪TLR2基因的开放阅读框编码蛋白的氨基酸数目均为785个,等电点分别为7.53和7.78,不稳定指数分别为43.76和42.86,平均亲水系数分别为-0.152和-0.146;二元杂交黑猪和三元杂交白猪TLR2蛋白的疏水性分值相同,但富含疏水性氨基酸的区域不同。TLR2蛋白的第1～588位氨基酸位于细胞膜外,具有识别微生物的功能,且两种仔猪的TLR2蛋白氨基酸在第13,16,17,19～21,143,164,248,249,296位不同。说明TLR2蛋白胞外识别区域氨基酸的差异可能会影响丁酸梭菌刺激产生的信号强度,进而影响丁酸梭菌对不同遗传背景仔猪TLR2信号通路的差异调控。