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高通量测序解析烟草苗床期基质细菌和真菌群落结构与多样性变化

文献类型: 中文期刊

作者: 罗飞 1 ; 李文红 2 ; 刘亭亭 3 ; 汪汉成 3 ; 孙美丽 3 ; 蔡刘体 3 ; 穆青 4 ; 余知和 1 ;

作者机构: 1.长江大学生命科学学院

2.贵州省植物保护研究所

3.贵州省烟草科学研究院

4.贵州省烟草公司黔西南州公司

关键词: 苗床期;育苗基质;Illumina MiSeq高通量测序;群落结构;烟苗;微生物多样性

期刊名称: 中国烟草学报

ISSN: 1004-5708

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 79-88

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【背景和目的】烟苗的生长发育状况与育苗基质微生物密切相关,为了解烟苗育苗阶段基质细菌和真菌群落结构与多样性特征。【方法】采用IlluminaMiSeq高通量测序对育苗基质中细菌和真菌群落进行测序与分析。【结果】不同育苗阶段基质(播种后第10~66 d)真菌和细菌在菌群结构及相对丰度均存在差异。基质中优势细菌门均为变形菌门Proteobacteria(65.60%~72.80%)、拟杆菌门Bacteroidetes(16.75%~21.35%)和酸杆菌门Acidobacteria(1.38%~4.67%);优势细菌属均为德沃斯氏菌属Devosia(4.81%~14.20%)、罗河杆菌属Rhodanobacter(1.60%~6.19%)、戴氏菌属Dyella(0.38%~8.92%)等,其中,德沃斯氏菌属和罗河杆菌属在播种第66 d的相对丰度较第10 d分别降低8.6%和3.31%。播种第38 d基质细菌Shannon多样性指数和ACE丰富度指数最低,分别为7.25和1161.10;播种第24 d和66 d基质细菌Shannon多样性指数最高,分别为8.15和8.01。基质中优势真菌门均为子囊菌门Ascomycota(16.84%~23.55%)、担子菌门Basidiomycota(4.93%~11.95%)和Aphelidiomycota(0.04%~5.32%);优势真菌属均为假裸囊菌属Pseudogymnoascus(0.42%~11.63%)、节丛孢属Arthrobotrys(0.28%~14.29%)、革菌属Tomentella(0.21%~8.96%)等,其中,节丛孢属和革菌属在播种第52 d的相对丰度较第10 d分别提高14.01%和8.57%。播种第24 d基质真菌Shannon多样性指数最低,为3.93;播种第10 d和52 d基质真菌Shannon多样性指数最高,分别为5.57和5.86。功能预测显示,播种66 d内烟苗基质细菌主要功能分布在代谢类、遗传信息处理类和环境信息处理类等;真菌主要功能分布在腐生类和外生菌根类。【结论】烟草苗床期基质细菌和真菌群落种类无显著变化,但其相对丰度与多样性指数在不同育苗阶段存在差异。

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