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基于FLUOstar平台的小麦dsDNA荧光定量与基因型分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖永贵 1 ; Susanne DREISIGACKER 2 ; Claudia NU?EZ-RíOS 2 ; 胡卫国 2 ; 夏先春 2 ; 何中虎 3 ;

作者机构: 1.国家小麦改良中心;International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT);河南省农业科学院小麦研究所;CIMMYT中国办事处

2.;国家小麦改良中心;International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT);河南省农业科学院小麦研究所;CIMMYT中国办事处

3.;国家小麦改良中心;International Maize and Wheat Improvement Center(CIMMYT);河南省农业科学院小麦研究所;CIMMYT中国办事处;

关键词: 普通小麦;dsDNA;荧光定量;显性标记;分子育种

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 947-953

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 双链DNA(dsDNA)定量分析是植物分子生物学研究的基础,对基因型分析尤为重要。本研究以λ噬菌体dsDNA为标准样品,建立了荧光定量标准曲线,探讨荧光核酸定量通量性及其与紫外法定量的差异,并分析荧光染料在基因分型中的应用。结果表明,荧光染料能够对dsDNA进行高效微量定量分析(<1.1ngmL-1),但因鉴定核酸的浓度较低,对小麦籽粒和叶片全基因组DNA定量时稀释倍数较大,易增大浓度误差。降低反应体系量导致标准曲线决定系数降低,影响测量准确性。精确定量dsDNA浓度时,总反应体系应大于200mL;对PCR产物进行基因分型时,总反应体系应不低于40mL。相同DNA模板浓度下,FLUOstar平台可以对抗秆锈病基因显性标记csSr32#1(Sr32)和IB-267(Sr50)的PCR产物进行基因型分型,判断准确率为100%。对特异性强且等位基因片段差异大(≥100bp)的共显性标记,如抗叶锈病基因标记We173(Yr26)等,用荧光染料同样可以进行基因分型。与琼脂糖凝胶电泳相比,荧光染料鉴定等位基因价格略高,但方法简单、准确快速、重现性好,可用于分子育种中世代材料快速筛选。

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