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木豆响应低温胁迫差异表达基因分析

文献类型： 中文期刊

作者： 唐军 1 ; 丁西朋 2 ; 陈志坚 2 ; 马向丽 1 ; 毕玉芬 1 ; 郭凤根 1 ;

作者机构： 1.云南农业大学动物科学技术学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词： 木豆;低温胁迫;转录组;转录因子;差异基因

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2022 年 30 卷 007 期

页码： 1701-1711

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨木豆[Cajanus cajan(L.)Millsp.]响应低温胁迫的机制,本研究以1份耐低温(MD)和1份低温敏感(QZ)木豆为试验材料,经4℃低温胁迫处理后进行RNA-seq测序分析,结果表明:2份木豆RNA-seq获得了丰富的转录本信息,对转录因子和差异表达基因的基因功能进行注释.木豆响应响应低温胁迫的转录因子主要包括MYB,AP2-EREBP等;在两份材料中,GO分析发现DEGs注释在细胞组成中"膜"和生物学过程中"细胞过程",KEGG分析均显著富集在"核糖体"通路中,而MD中还显著富集在植物激素信号转导、昼夜节律-植物等通路.通过两份材料对比,在MD材料中发现特有与耐低温相关的150个DEGs,主要为α-1,4-葡萄糖苷酶,参与碳水化合物、脂质代谢等途径.还筛选37个与耐寒相关重要差异表达基因和14条通路,并对10个DEGs进行qRT-PCR验证.本文从分子水平阐述了木豆低温胁迫下的响应机制,为未来木豆的抗寒育种奠定了理论基础.

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