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吉林省农业科学院作物资源研究所前身是原东北农业科学院农产系，1959 年成立吉林省农业科学院农产系，后经调整成立作物育种研究所。2008年，农作物种质资源平台作为吉林省农业科学院五大公共技术平台之一挂靠研究所。2012年7月，作物育种研究所更名为作物资源研究所。
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